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J-GLOBAL ID：202102282643559488   整理番号：21A1373494

CLUにおけるアルツハイマー病リスク変異体の代替スプライシング調節【JST・京大機械翻訳】

Alternative Splicing Regulation of an Alzheimer’s Risk Variant in CLU

著者 (4件)： Han Seonggyun (Department of Biomedical Informatics, University of Utah School of Medicine, Salt Lake City, UT 84108, USA) ,  Nho Kwangsik (Department of Radiology and Imaging Sciences and Indiana Alzheimer Disease Center, Indiana University School of Medicine, Indianapolis, IN 46202, USA) ,  Nho Kwangsik (Center for Computational Biology and Bioinformatics, Indiana University School of Medicine, Indianapolis, IN 46202, USA) ,  Lee Younghee (Department of Biomedical Informatics, University of Utah School of Medicine, Salt Lake City, UT 84108, USA)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 21  号： 19  ページ： 7079  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： クラステリン(CLU)は後期発症Alzheimer病(AD)に最も関連するリスク遺伝子の1つであり,CLUにおけるいくつかの遺伝的変異はADリスクと関連する。しかし,CLUにおける既知のADリスク遺伝的変異体の機能的役割はほとんど研究されていない。脳-組織に基づくRNA-Seqの統合的アプローチと,加速医学パートナーシップアルツハイマー病(AMP-AD)からの全ゲノム配列決定データを用い,オルタナティブスプライシングに対するCLUの5番目のエクソンにおけるADリスク変異体(rs7982)の影響を検討した。RNA-Seqデータは,側頭皮質の側頭葉,上側頭回,および海馬傍回における3つの領域から発生した。rs7982はCLUの5番目のエキソンのイントロン保持(IR)と有意に関連していた;代替対立遺伝子(G)の数が増加するにつれて,IR率は雄より雌で有意に減少した。本結果は,スプライシング調節を介したAD病因におけるrs7982の性依存的役割を示唆する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RNA【核酸】 ,  側頭葉 ,  イントロン ,  *Alzheimer病 ,  *選択的スプライシング ,  病因
準シソーラス用語： 海馬傍回 ,  クラステリン ,  ゲノム配列 ,  遺伝的変異 ,  リスク遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： CLU ,  アルツハイマー病 ,  選択的スプライシング ,  sQTL

分類 (3件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  呼吸器の腫よう  (GI04000G) ,  疫学  (GB03000E)

引用文献 (26件)：

• Buee, L.; Bussiere, T.; Buee-Scherrer, V.; Delacourte, A.; Hof, P.R. Tau protein isoforms, phosphorylation and role in neurodegenerative disorders. Brain Res. Rev. 2000, 33, 95-130.
• Rockenstein, E.M.; McConlogue, L.; Tan, H.; Power, M.; Masliah, E.; Mucke, L. Levels and alternative splicing of amyloid beta protein precursor (APP) transcripts in brains of APP transgenic mice and humans with Alzheimer’s disease. J. Biol. Chem. 1995, 270, 28257-28267.
• Koch, L. Altered splicing in Alzheimer transcriptomes. Nat. Rev. Genet. 2018, 19, 738-739.
• Wang, G.S.; Cooper, T.A. Splicing in disease: Disruption of the splicing code and the decoding machinery. Nat. Rev. Genet. 2007, 8, 749-761.
• Raj, T.; Li, Y.I.; Wong, G.; Humphrey, J.; Wang, M.; Ramdhani, S.; Wang, Y.C.; Ng, B.; Gupta, I.; Haroutunian, V.; et al. Integrative transcriptome analyses of the aging brain implicate altered splicing in Alzheimer’s disease susceptibility. Nat. Genet. 2018, 50, 1584-1592.

タイトルに関連する用語 (5件)： アルツハイマー病 ,  リスク ,  変異体 ,  代替スプライシング ,  調節