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J-GLOBAL ID：202102283168820987   整理番号：21A2843791

アフリカ遺伝子型ジカウイルスに対するCodon利用進化の生物学的特性とパターン【JST・京大機械翻訳】

Biological Characteristics and Patterns of Codon Usage Evolution for the African Genotype Zika Virus

著者 (9件)： Faye Martin (Virology Department Institut Pasteur of Dakar, Dakar 220, Senegal) ,  Zein Naimah (Institute of Genetics and Molecular and Cellular Biology, CEDEX, 10142/67404 Illkirch, France) ,  Loucoubar Cheikh (Bioinformatics, Biostatistics and Modeling group, Institut Pasteur of Dakar, Dakar 220, Senegal) ,  Weidmann Manfred (Institute of Aquaculture University of Stirling, Stirling FK9 4LA, Scotland, UK) ,  Faye Ousmane (Virology Department Institut Pasteur of Dakar, Dakar 220, Senegal) ,  Cunha Marielton dos Passos (Microbiology Department, Institute of Biomedical Sciences, University of Sao Paulo (USP), Sao Paulo, SP 05508020, Brazil) ,  Zanotto Paolo Marinho de Andrade (Microbiology Department, Institute of Biomedical Sciences, University of Sao Paulo (USP), Sao Paulo, SP 05508020, Brazil) ,  Sall Amadou Alpha (Virology Department Institut Pasteur of Dakar, Dakar 220, Senegal) ,  Faye Oumar (Virology Department Institut Pasteur of Dakar, Dakar 220, Senegal)
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 12  号： 11  ページ： 1306  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 異なる宿主種に対するコドン利用変化の時間的傾向を調べ,Zikaウイルス(ZIKV)進化におけるそれらの重要性を決定した。宿主ゲノムへのコドン適応の可能性から生じるウイルススピルオーバもアジア遺伝子型と比較してアフリカ遺伝子型ZIKVに対して評価した。その遊走維持に関する理解を改善するために,脊椎動物および蚊細胞株におけるアフリカ遺伝子型ZIKVの生物学的性質を評価した。分析は黄熱ウイルス(YFV)と比較した。YFVよりも有意に低いコドン適応指数傾向にもかかわらず,ZIKVは脊椎動物宿主への明白なコドン適応,特にグリーンアフリカサルChlorocebusaethiopsを示した。ヒトとAedes aegyptiの個々のZIKV遺伝子レベルでのPCAとCAI分析は,2つの遺伝子型間の明確な区別を示した。アフリカZIKV分離株は,脊椎動物細胞より蚊細胞でより高い毒性を示した。アフリカのYFVよりも蚊細胞における高い複製はアフリカの遺伝子型ZIKVの自然維持における蚊の役割を確認した。個々の菌株増殖特性の解析は,広く使われている参照株MR766がアフリカのZIKV分離株と比較して,よく複製しないことを示した。組換えアフリカZikaウイルス株ArD128000*E/NS5は,試験した脊椎動物細胞株で複製できないので,宿主指向性の機構に関する研究を含む良いモデルである可能性がある。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  *遺伝子型 ,  コドン ,  脊椎動物 ,  ヒト ,  ゲノム ,  アジア ,  アフリカ ,  指向性 ,  ネッタイシマカ ,  スピルオーバ
準シソーラス用語： 細胞株 ,  遊走 ,  分離株 ,  *Zika virus , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： アフリカ遺伝子型ジカウイルス ,  コドン適応動力学 ,  生物学的特性

分類 (2件)： ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (90件)：

• Dick, G.W.; Kitchen, S.F.; Haddow, A.J. Zika virus isolations and serological specificity. Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 1952, 46, 509-520.
• Hayes, E.B. Zika virus outside Africa. Emerg. Infect. Dis. 2009, 15, 1347-1350.
• Weinbren, M.P.; Williams, M.C. Zika virus: Further isolations in the Zika area and some studies on the strains isolated. Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 1958, 52, 263-268.
• Haddow, A.J.; Williams, M.C.; Woodall, J.P.; Simpson, D.I.H.; Goma, L.K. Twelve isolations of Zika virus from Aedes (Stegomyia) africanus (Theobald) taken in and above a Ugandan forest. Bull. World Health Organ. 1964, 31, 57-69.
• Marchette, N.J.; Garcia, R.; Rudnick, A. Isolation of Zika virus from Aedes aegypti mosquitoes in Malaysia. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1969, 18, 411-415.

タイトルに関連する用語 (5件)： アフリカ ,  遺伝子型 ,  ジカウイルス ,  進化 ,  生物学的特性