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J-GLOBAL ID：202102284982048084   整理番号：21A0022270

遺伝的ボトルネックを生き残る選択された集団から開発されたジャガイモウイルスSの感染性cDNAクローンの構築と特性化【JST・京大機械翻訳】

Construction and characterization of an infectious cDNA clone of potato virus S developed from selected populations that survived genetic bottlenecks

著者 (2件)： Li Xin (Laboratory of Pathogen-Plant Interactions, Graduate School of Agriculture, Hokkaido University, Sapporo, Japan) ,  Hataya Tatsuji (Laboratory of Pathogen-Plant Interactions, Research Faculty of Agriculture, Hokkaido University, Sapporo, Japan)
資料名： Virology Journal (Web)  (Virology Journal (Web))
巻： 16  号： 1  ページ： 1-15  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7347A  ISSN： 1743-422X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 感染cDNAクローンは,逆遺伝学を用いたRNAウイルスに関する研究のための強力なツールである。ジャガイモウイルスS(PVS)は世界的な分布を有するカラウイルスである。多くのPVS分離株の完全なゲノム配列が報告されているが,PVSの感染性cDNAクローンの構築はまだ報告されていない。本研究の目的は,PVSの感染性cDNAクローンの開発と分子特性化である。完全長cDNAクローンpPVS-H-FL-ABを,PVS分離株H95の8つのcDNAクローンを接続することによって構築した。PVS-H95のコンセンサスゲノム配列を含むpPVS-H-FL-ABと修飾クローンpPVS-H-FL-HからのキャップRNA転写物は非感染であることを証明した。従って,完全長cDNAクローンpPVS-H-FL-βを,PVS-H00から再構築し,PVS-H95個体群から分離した。PVS-H00は遺伝的ボトルネックを生き残った選択された変異体であるように見えた。cDNAクローンpPVS-H-FL-βの配列をPVS-H00のゲノム配列として測定し,PVS-H95ゲノムのコンセンサス配列と比較した。pPVS-H-FL-β由来の≧0.2μgのキャップRNA転写物を接種したすべてのNicotiana occidentalis植物は,PVS-H00接種で観察されたように,上葉に症状を発現した。ウイルスゲノムおよびサブゲノムRNAおよびコート蛋白質の類似レベルを,全身感染葉において検出した。PVS-H95とPVS-H00の配列比較は,370のヌクレオチド多型(全ゲノム配列の4.4%)を明らかにし,6つのオープンリーディングフレーム(ORF)で91のアミノ酸置換を引き起こした。2つのcDNAクローン間の組換え体に由来するキメラRNAの感染性は,pPVS-H-FL-H転写物の感染性の欠如が複製をコード化し,pPVS-H-FL-βと比較して80アミノ酸置換をコードするORF1によることを明らかにした。レプリカーゼの約71.3%のアミノ酸置換が,推定メチルトランスフェラーゼと卵巣腫瘍様プロテアーゼドメイン間の未知の機能の可変領域内に位置した。これはPVSの感染性cDNAクローンの開発の最初の報告である。本解析は,植物内のPVS個体群が準種として存在し,PVSのレプリカ配列多様性が完全長感染性cDNAクローンの構築を妨げることを示唆する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RNA【核酸】 ,  ゲノム ,  キメラ ,  RNAウイルス ,  メチルトランスフェラーゼ ,  *クローン ,  個体群 ,  RNAレプリカーゼ ,  タバコ属
準シソーラス用語： アミノ酸置換 ,  ウイルスゲノム ,  オープンリーディングフレーム ,  コート蛋白質 ,  ゲノム配列 ,  逆遺伝学 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： ジャガイモウイルスS ,  カラウイルス ,  感染性cDNAクローン ,  遺伝的ボトルネック ,  準種 ,  多様性 ,  Solanum tuberosum

分類 (2件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  ウイルスの生理一般  (EG04041H)

引用文献 (41件)：

• German TL. Compendium of potato diseases, 2nd ed: Potato virus S. In: Stevenson WR, Loria R, Franc GD, Weingartner DP, editors. American Phytopathological society. St. Paul, MN; 2001. p. 67-68.
• Plant Dis; Biological properties of Potato virus X in potato: effects of mixed infection with Potato virus S and resistance phenotypes in cultivars from three continents; EP Nyalugwe, CR Wilson, BA Coutts, RA Jones; 96; 2012; 43-54; 10.1094/PDIS-04-11-0305; citation_id=CR2
• Plant Dis; Identification of an isolate of the Andean strain of potato virus S in North America; SA Slack; 67; 1983; 786-789; 10.1094/PD-67-786; citation_id=CR3
• Virus and virus-like disease of potatoes and production of seed-potatoes: 5.7 (PVS; genus ); 2001; 109-112; CR4; AA Brunt; citation_publisher=Kluwer Academic Publishers
• Plant Dis; Strain characterization of Potato virus S isolates from Tasmania, Australia; SJ Lambert, JB Scott, SJ Pethybridge, FS Hay; 96; 2012; 813-819; 10.1094/PDIS-07-11-0573; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (9件)： 遺伝的ボトルネック ,  集団 ,  開発 ,  ジャガイモ ,  ウイルス ,  感染性 ,  cDNAクローン ,  構築 ,  特性化