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J-GLOBAL ID：202102285134493125   整理番号：21A0394897

まばらな典型的な相関に基づく汎癌CNVsとmRNAの共同分析【JST・京大機械翻訳】

Fusion Analysis of CNVs and mRNA for Pan-cancer based on Joint Sparse Canonical Correlation Analysis

著者 (7件)： Hou Xiaowen (哈爾浜医科大学衛生統計学教研室 150081) ,  Zhang Qiuju (哈爾浜医科大学衛生統計学教研室 150081) ,  Tian Wei (哈爾浜医科大学衛生統計学教研室 150081) ,  Li Cheng (哈爾浜医科大学衛生統計学教研室 150081) ,  Cong Yuxin (哈爾浜医科大学衛生統計学教研室 150081) ,  Zhao Min (哈爾浜医科大学衛生統計学教研室 150081) ,  Liu Meina (哈爾浜医科大学衛生統計学教研室 150081)
資料名： Zhongguo Weisheng Tongji  (Zhongguo Weisheng Tongji)
巻： 37  号： 5  ページ： 687-690  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2278A  ISSN： 1002-3674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】ヒト癌のコピー数変異(CNVs)とmRNAデータ融合分析を併用して,遺伝子発現に及ぼすコピー数の影響を研究し,分子メカニズムのホモロジーと特異性を同定し,癌の分子機構研究のための基礎を提供する。方法:汎癌CNVsとmRNAデータ融合分析を疎正相関法により行い、汎癌における共存CNVs及びその関連mRNAを抽出し、関連モジュールを構築した。これに基づいて,直接関係を有するCNVs-mRNAペアを,疎な正確なマトリックス推定アルゴリズムによってスクリーニングして,CNVsと種々の腫瘍病期の間の相関関係を分析した。【結果】CNVsとmRNAの変数数は,それぞれ195と177であり,そのうち13のmRNAは全癌に存在し,38のmRNAは単一癌に特異的に存在した。11のCNVs部位を含む16対のCNVs-mRNA対をスクリーニングし,対応する遺伝子EYA2とNNATは,多くの癌で発見した。相関検定により、全11個の遺伝子コピー数が結腸癌のT、N期、腎明細胞癌のT、M期、浸潤性乳癌のT期と相関することが明らかになった。結論:CNVs-mRNA相関関係は汎癌の間に同質性と特異性があり、同質性関係は汎癌の薬物作用標的の識別に用いられ、特異性関係は癌の遺伝的変異が遺伝子発現の特異性に対する影響を研究するのに手がかりを提供することができる。CNVs-mRNAの直接相関は中部分の遺伝子コピー数に腫瘍分期と相関があり、相応するCNVsは遺伝子発現に対して強い影響があるかもしれない。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *mRNA ,  遺伝子 ,  腫瘍 ,  ヒト ,  ホモロジー ,  遺伝子発現 ,  コピー数 ,  結腸腫瘍 ,  腫瘍進行度 ,  データ融合
準シソーラス用語： 分子機構 ,  M期 ,  遺伝的変異 ,  浸潤性乳癌 ,  腎明細胞癌 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 統計学  (AB08000H) ,  医用情報処理  (JE15030Q) ,  医療制度  (GB04020H)

タイトルに関連する用語 (5件)： 相関 ,  癌 ,  mRNA ,  共同 ,  分析