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J-GLOBAL ID：202102285869751830   整理番号：21A1432841

ゲノム情報,比較解析および系統学的関係を同定するための2つのProsopis種の葉緑体ゲノムの解明【JST・京大機械翻訳】

Unraveling the Chloroplast Genomes of Two Prosopis Species to Identify Its Genomic Information, Comparative Analyses and Phylogenetic Relationship

著者 (4件)： Asaf Sajjad (Natural and Medical Sciences Research Center, University of Nizwa, Nizwa 616, Oman) ,  Khan Abdul Latif (Natural and Medical Sciences Research Center, University of Nizwa, Nizwa 616, Oman) ,  Khan Arif (Genomics Group, Faculty of Biosciences and Aquaculture, Nord University, 8049 Bodo, Norway) ,  Al-Harrasi Ahmed (Natural and Medical Sciences Research Center, University of Nizwa, Nizwa 616, Oman)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 21  号： 9  ページ： 3280  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Genus Prosopis(科Fabaceae)は,アジア,アフリカ,およびアメリカの乾燥および半乾燥地帯に固有で,窒素固定のために知られている潅木の木である。ここでは,2つのProsopis種(P.julifloraとP.cineraria)の完全な葉緑体(cp)ゲノムを配列決定し,それらを以前に配列決定したP.glandulosa,Adenantheraミクロ精子,および同じファミリーに属するParkia javanicaと比較した。Prosopis種および関連種の完全なゲノム配列は,159,389bp(A.microsperma)から163,677bp(P.cineraria)の範囲であった。ゲノムの全GC含有量はほぼ同じであった(35.936.6%)。P.julifloraとP.cinerariaゲノムは,それぞれ132と131の遺伝子をコード化したが,一方,両種は,他の比較種より高い85の蛋白質コード遺伝子から成った。P.juliflora,P.cineraria及びP.glandulosa cpゲノムにおいて,それぞれ140,134及び129反復を同定した。同様に,単純配列反復の最大数をP.juliflora(88),P.cineraria(84)およびP.glandulosa(78)において測定した。さらに,完全なcpゲノム比較は,P.juliflora,P.cineraria,およびP.glandulosaの間の高度な配列類似性を決定したが,A.microspermaおよびParkia javanicaの遺伝子間スペーサーにおけるいくつかの相違が観察された。系統発生分析は,P.julifloraがP.cylnerariaよりP.cylnerariaに近いことを示した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  *葉緑体 ,  精子 ,  タンパク質 ,  窒素固定 ,  *ゲノム ,  マメ科 ,  アジア ,  アフリカ ,  灌木 ,  半乾燥地帯
準シソーラス用語： 系統解析 ,  ゲノム配列 ,  葉緑体ゲノム ,  *ゲノム情報 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 色素体ゲノム ,  Fabaceae ,  系統学的位置 ,  比較分析 ,  逆反復

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (107件)：

• Burkart, A. A monograph of the genus Prosopis (Leguminosae subfam. Mimosoideae). J. Arnold Arbor. 1976, 57, 450-525.
• Shackleton, R.T.; Le Maitre, D.C.; Pasiecznik, N.M.; Richardson, D.M. Prosopis: A global assessment of the biogeography, benefits, impacts and management of one of the world’s worst woody invasive plant taxa. AoB Plants 2014, 6, plu027.
• Prado, D.E.; Gibbs, P.E. Patterns of Species Distributions in the Dry Seasonal Forests of South America. Ann. Mo. Bot. Gard. 1993, 80, 902.
• Bessega, C.; Pometti, C.L.; Ewens, M.; Saidman, B.O.; Vilardi, J.C. Strategies for conservation for disturbed Prosopis alba (Leguminosae, Mimosoidae) forests based on mating system and pollen dispersal parameters. Tree Genet. Genomes 2011, 8, 277-288.
• Bessega, C.; Ferreyra, L.; Julio, N.; Montoya, S.; Saidman, B.; Vilardi, J.C. Mating system parameters in species of genus Prosopis (Leguminosae). Hered. 2000, 132, 19-27.

タイトルに関連する用語 (6件)： ゲノム情報 ,  解析 ,  系統学 ,  同定 ,  Prosopis ,  葉緑体ゲノム