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J-GLOBAL ID：202102286370153885   整理番号：21A0021042

分子分析と全ゲノム増幅のための迅速診断試験キットからのPlasmodium falciparum DNAの有用性【JST・京大機械翻訳】

Utility of Plasmodium falciparum DNA from rapid diagnostic test kits for molecular analysis and whole genome amplification

著者 (17件)： Srisutham Suttipat (Department of Clinical Microscopy, Faculty of Allied Health Sciences, Chulalongkorn University, Bangkok, Thailand) ,  Srisutham Suttipat (Mahidol-Oxford Tropical Medicine Research Unit, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, Thailand) ,  Suwannasin Kanokon (Mahidol-Oxford Tropical Medicine Research Unit, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, Thailand) ,  Mathema Vivek Bhakta (Department of Molecular Tropical Medicine and Genetics, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, Thailand) ,  Sriprawat Kanlaya (Shoklo Malaria Research Unit, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Mae Sot, Thailand) ,  Smithuis Frank M. (Myanmar Oxford Clinical Research Unit, Yangon, Myanmar) ,  Smithuis Frank M. (Centre for Tropical Medicine and Global Health, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Smithuis Frank M. (Medical Action Myanmar, Yangon, Myanmar) ,  Nosten Francois (Shoklo Malaria Research Unit, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Mae Sot, Thailand) ,  Nosten Francois (Centre for Tropical Medicine and Global Health, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford, Oxford, UK) ,  White Nicholas J. (Mahidol-Oxford Tropical Medicine Research Unit, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, Thailand) ,  White Nicholas J. (Centre for Tropical Medicine and Global Health, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Dondorp Arjen M. (Mahidol-Oxford Tropical Medicine Research Unit, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, Thailand) ,  Dondorp Arjen M. (Centre for Tropical Medicine and Global Health, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Imwong Mallika (Mahidol-Oxford Tropical Medicine Research Unit, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, Thailand) ,  Imwong Mallika (Department of Molecular Tropical Medicine and Genetics, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, Thailand) ,  Imwong Mallika (Centre for Tropical Medicine and Global Health, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford, Oxford, UK)
資料名： Malaria Journal (Web)  (Malaria Journal (Web))
巻： 19  号： 1  ページ： 1-8  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7332A  ISSN： 1475-2875  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 迅速診断試験(RDT)は,特に遠隔地でPlasmodium falciparumマラリアの検出に対する最も一般的な診断ツールとなっている。RDT血液スポットは,分子分析のための寄生虫DNAの供給源を提供する。本研究では,分子分析のためのRDTの有用性と全ゲノム増幅のための異なる方法の性能について調べた。陽性P.falciparum RDTを2014年8月から2016年1月までのKayin,Myanmarから採取した。RDT試料は,DNA抽出の6か月,9か月,20か月,21か月および32か月,およびその後のP.falciparum kelch 13(pfkelch13)変異,P.falciparum多剤耐性1(pfmdr1)およびP.falciparum plasma 2(pfplasmain2)遺伝子増幅の分子的分析に貯蔵された。さらに,REPLI-g,MALBACTM,PicoPLEX,およびゲノムPlexを含む4つの全ゲノム増幅(WGA)キットの性能を比較し,DNA量と品質を元のDNAとポストWGA製品の間で比較した。6,9,20,21,または32か月貯蔵されたRDTから分析した血液スポット間で,異なる分子マーカーの成功した増幅の割合は類似していた。増幅の成功は,分子標識断片長(p値<0.05)に依存し,pfkelch13の1245bpフラグメントの18%,pfkelch13の364bpに対する71%,pfmdr1の87bpの81%,pfplasplasin2の108bpの81%であった。4つのWGAアッセイキットの比較は,REPLI-g,MALBACTM,およびPicoPLEXが,DNA60から750倍に増加し,一方,ヒトDNA上の寄生虫DNA増幅の比がMALBACに最も好ましいことを示した。pfkelch13,P.falciparumクロロキン耐性輸送体(pfcrt),P.falciparumジヒドロ葉酸レダクターゼ(pfdhfr)の配列決定結果およびWGA後産物から評価した6つのマイクロサテライトマーカーは,元のDNAと同じであった。RDTからの血液スポットは,32か月までの貯蔵後でも,P.falciparumの分子分析のための良好な源である。RDT由来寄生虫DNAのWGAは,耐性マーカーの分子解析のための十分な品質でDNA量を確実に増加させた。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *DNA【核酸】 ,  寄生虫 ,  ヒト ,  マラリア ,  *ゲノム ,  *マラリア原虫 ,  *Plasmodium falciparum ,  遺伝子増幅 ,  多剤耐性
準シソーラス用語： 分子マーカー ,  *迅速診断 ,  マイクロサテライトマーカー ,  DNA抽出 ,  DNA増幅 ,  *全ゲノム増幅 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Plasmodium falciparum ,  RDT ,  全ゲノム増幅

分類 (1件)： 感染症・寄生虫症の診断  (GD01020S)

引用文献 (27件)：

• J Med Microbiol; Malaria rapid diagnostic tests: challenges and prospects; JC Mouatcho, JP Goldring; 62; 2013; 1491-1505; 10.1099/jmm.0.052506-0; citation_id=CR1
• Am J Trop Med Hyg; Recovery and use of Plasmodium DNA from malaria rapid diagnostic tests; V Veron, B Carme; 74; 2006; 941-943; 10.4269/ajtmh.2006.74.941; citation_id=CR2
• Malar J; Rapid diagnostic tests as a source of DNA for Plasmodium species-specific real-time PCR; L Cnops, M Boderie, P Gillet, M Esbroeck, J Jacobs; 10; 2011; 67; 10.1186/1475-2875-10-67; citation_id=CR3
• Malar J; Using rapid diagnostic tests as source of malaria parasite DNA for molecular analyses in the era of declining malaria prevalence; DS Ishengoma, S Lwitiho, RA Madebe, N Nyagonde, O Persson, LS Vestergaard; 10; 2011; 6; 10.1186/1475-2875-10-6; citation_id=CR4
• Parasite; Distribution of Plasmodium species on the island of Grande Comore on the basis of DNA extracted from rapid diagnostic tests; N Papa Mze, AD Ahouidi, CK Diedhiou, R Silai, M Diallo, D Ndiaye; 23; 2016; 34; 10.1051/parasite/2016034; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (8件)： 分子 ,  分析 ,  全ゲノム増幅 ,  迅速診断 ,  試験 ,  Plasmodium ,  DNA ,  有用性