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J-GLOBAL ID：202102287007841497   整理番号：21A0201326

ヒト転写エフェクターのハイスループット発見と特性化【JST・京大機械翻訳】

High-Throughput Discovery and Characterization of Human Transcriptional Effectors

著者 (16件)： Tycko Josh (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  DelRosso Nicole (Biophysics Program, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Hess Gaelen T. (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Aradhana (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Banerjee Abhimanyu (Department of Physics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Mukund Aditya (Biophysics Program, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Van Mike V. (Department of Biology, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Ego Braeden K. (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Yao David (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Spees Kaitlyn (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Suzuki Peter (Department of Bioengineering, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Marinov Georgi K. (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Kundaje Anshul (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Kundaje Anshul (Department of Computer Science, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Bassik Michael C. (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Bintu Lacramioara (Department of Bioengineering, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 183  号： 7  ページ： 2020-2035.e16  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質のThousandsは核に局在し;しかし,転写エフェクターを含むことは不明なままである。ここに,蛋白質ライブラリーをレポーターに動員するプールアッセイであるHT-recruitを開発し,それらの転写効果を配列決定により測定した。このアプローチを用いて,数千のドメインに対する遺伝子サイレンシングと活性化を測定した。KRABドメインに対するレプレッサー機能と進化年齢の間の関係を見出し,ホメオドメインレプレッサー強度がHox遺伝子構成と共線形であり,未知の機能の何種類かのドメインに対する活性を同定することを見出した。CRISPRi KRABの深い変異走査はコレプレッサー結合表面をマップし,安定性/サイレンシングを改善する置換を同定した。238の蛋白質をタイリングすることによって,10のアミノ酸と同様にレプレッサーを見つける。最後に,分岐KRABを含む新しい活性化ドメインを報告する。これらの結果は,エフェクターを含む600のヒト蛋白質の資源を提供し,蛋白質ドメインに機能を割り当てるためのスケーラブルな戦略を示す。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アミノ酸 ,  クロマチン ,  タンパク質 ,  突然変異 ,  *ヒト ,  哺乳類 ,  レプレッサー ,  キャラクタリゼーション ,  エフェクタ ,  ホメオボックス遺伝子 ,  遺伝子サイレンシング
準シソーラス用語： ドメイン構造 ,  *ハイスループット ,  コリプレッサー ,  タンパク質ドメイン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： クロマチン調節 ,  蛋白質ドメイン ,  ハイスループットスクリーニング ,  転写エフェクター ,  哺乳類合成生物学 ,  KRAB ,  Hox ,  CRISPRI ,  深い突然変異スキャン ,  未知関数の領域

分類 (2件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (6件)： ヒト ,  転写 ,  エフェクター ,  ハイスループット ,  発見 ,  特性化