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J-GLOBAL ID：202102287418043803   整理番号：21A0571801

60K SNPチップを用いた韓国在来ブタの遺伝的多様性と祖先研究【JST・京大機械翻訳】

Genetic Diversity and Ancestral Study for Korean Native Pigs Using 60K SNP Chip

著者 (11件)： Lee Soo Hyun (Division of Animal and Dairy Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Seo Dong Won (Division of Animal and Dairy Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Cho Eun Seok (Swine Science division, National Institute of Animal Science, RDA, Seonghwan 31000, Korea) ,  Choi Bong Hwan (Animal Genomics and Bioinformatics Division, National Institute of Animal Science, RDA, WanJu 55365, Korea) ,  Kim Yong Min (Swine Science division, National Institute of Animal Science, RDA, Seonghwan 31000, Korea) ,  Hong Joon Ki (Swine Science division, National Institute of Animal Science, RDA, Seonghwan 31000, Korea) ,  Han Hyo Dong (Research and Development Division, Korea Institute for Animal Products Quality Evaluation, Areumseo-gil 21, Sejong 30100, Korea) ,  Jung Yeon Bok (Research and Development Division, Korea Institute for Animal Products Quality Evaluation, Areumseo-gil 21, Sejong 30100, Korea) ,  Kim Dong Jun (Research and Development Division, Korea Institute for Animal Products Quality Evaluation, Areumseo-gil 21, Sejong 30100, Korea) ,  Choi Tae Jeong (Swine Science division, National Institute of Animal Science, RDA, Seonghwan 31000, Korea) ,  Lee Seung Hwan (Division of Animal and Dairy Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea)
資料名： Animals (Web)  (Animals (Web))
巻： 10  号： 5  ページ： 760  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7131A  ISSN： 2076-2615  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 韓国の天然ブタ(KNP;Sus scrofa coreanus)は,韓国の土着のブタ品種であり,貴重な,しかし,巻き戻しの遺伝資源と考えられている。多様な方法論と遺伝子マーカーを用いた研究は,この個体群が中国北東部のManchu省に由来し,韓国半島に約3000年前に移動したことを示唆する。本研究は,世界中の47品種の891ブタにおける60K単一ヌクレオチド多型(SNP)BeadChipを用いて,多様性と祖先分析を実施することにより,これらの知見を検証することを目的とした。また,主成分分析(PCA),祖先分析,SNPhyloを用いた系統樹解析,および連鎖不平衡解析も行った。さらに,著者らは,Neis遺伝的距離とFST値を得て,市販の韓国ブタのヘテロ接合性を調べた。結果は,KNPブタが中国品種よりヨーロッパ品種に密接に関連していることを示した。加えて,以前の研究が示唆したように,著者らの混和分析は,KNPブタが識別可能な遺伝的構造を示すことを示した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 大韓民国 ,  ヨーロッパ ,  *品種 ,  個体群 ,  主成分分析 ,  半島 ,  遺伝資源 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： 遺伝子マーカ ,  連鎖不平衡 ,  遺伝的構造 ,  遺伝距離 ,  系統解析 ,  ヘテロ接合性 ,  *遺伝多様性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 多様性研究 ,  祖先 ,  韓国在来ブタ ,  世界的なブタ ,  SNP ,  60Kビーズチップ

分類 (1件)： 豚  (FD02040U)

引用文献 (26件)：

• Larson, G.; Dobney, K.M.; Albarella, U.; Fang, M.; Matisoo-Smith, E.; Robins, J.; Lowden, S.; Finlayson, H.; Brand, T.; Willerslev, E.; et al. Worldwide Phylogeography of Wild Boar Reveals Multiple Centers of Pig Domestication. Science 2005, 307, 1618-1621.
• Kariyawasam, K.; Tsai, M. Access to genetic resources and benefit sharing: Implications of Nagoya Protocol on providers and users. J. World Intellect. Prop. 2018, 21, 289-305.
• Chung, H.Y.; Ko, M.S. Characteristics and Application of Native Pigs in Jeju, South Korea. Soc. Cheju Stu. 2006, 1, 95-119.
• Seo, S.Y.; Park, K.M.; Seo, H.W.; Cho, S.H.; Park, B.Y.; Cho, I.C.; Sung, P.N. Pork Quality Characteristics of Different Parts from Crossbred (Jeju Native Pig × Landrace) Pigs. J. Agric. Life Sci. 2015, 49, 211-223.
• Kim, D.W.; Kim, K.H.; Hong, J.K.; Cho, K.H.; Sa, S.J.; Park, J.C.; Choi, S.H. Comparison of Carcass Characteristics, Meat Quality, Amino Acids Contents, and Fatty Acid Profiles of Korea Native Pig by Gender. Reprod. Dev. Biol. 2013, 37, 129-134.

タイトルに関連する用語 (5件)： SNPチップ ,  韓国 ,  ブタ ,  遺伝的多様性 ,  研究