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J-GLOBAL ID：202102287913541104   整理番号：21A1852122

トランスクリプトームシークエンシングに基づくスイートコーンの低温発芽耐性関連遺伝子の解析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of Genes Related to Low-temperature Germination Ability in Sweet Corn Based on Transcriptome Sequencing

著者 (9件)： Li Wu (广東省農業科学院作物研究所/广東省農作物遺伝改良重点実験室,广東 广州 510640) ,  Li Guangyu (广東省農業科学院作物研究所/广東省農作物遺伝改良重点実験室,广東 广州 510640) ,  Xiao Yingni (广東省農業科学院作物研究所/广東省農作物遺伝改良重点実験室,广東 广州 510640) ,  Hu Jianguang (广東省農業科学院作物研究所/广東省農作物遺伝改良重点実験室,广東 广州 510640) ,  Li Chunyan (广東省農業科学院作物研究所/广東省農作物遺伝改良重点実験室,广東 广州 510640) ,  Li Yuliang (广東省農業科学院作物研究所/广東省農作物遺伝改良重点実験室,广東 广州 510640) ,  Lu Wenjia (广東省農業科学院作物研究所/广東省農作物遺伝改良重点実験室,广東 广州 510640) ,  Li Gaoke (广東省農業科学院作物研究所/广東省農作物遺伝改良重点実験室,广東 广州 510640) ,  Liu Jianhua (广東省農業科学院作物研究所/广東省農作物遺伝改良重点実験室,广東 广州 510640)
資料名： Guangdong Nongye Kexue  (Guangdong Nongye Kexue)
巻： 48  号： 3  ページ： 11-18  発行年： 2021年 
JST資料番号： C4503A  ISSN： 1004-874X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]低温発芽能力が異なる甘いトウモロコシ近交系をトランスクリプトームシークエンシングにより分析し、甘いトウモロコシの低温発芽に関連する遺伝子を同定する。[方法]低温発芽能力の強いスイートコーン近交系Scil-H7thをドナーとして、近等遺伝子系を構築し、異なる低温発芽能力の材料を獲得し、生理指標測定、トランスクリプトーム分析とqRT-PCRにより、低温発芽に関連する遺伝子をスクリーニングした。[結果]異なる発芽時期と同一発芽時期における自殖系間の遺伝子発現量を比較し、異なる材料が同じ発芽時期の4つの比較グループに共通する差異発現遺伝子410個を獲得した。65遺伝子は高種子活力材料Scil-H7thと近等遺伝子系統L18でのみ発現し、低種子活力の輪回親Scil-C4thでは発現しなかった。これらの遺伝子のうち、32個の遺伝子の機能が既知であり、生物情報学分析と発現量分析を結びつけ、交雑した20個のDEGsを選別し、これらの遺伝子は低温発芽と密接に関連すると推測した。qRT-PCRを用いて、そのうち最も低温発芽に関与する可能性がある7つのアップレギュレーション発現遺伝子に対して発現量検証を行い、そのうちUDP-グルコシルトランスフェラーゼをコードする遺伝子Zm001d037383(UGT1)はDP胚部で発現が著しく他の組織より高い。この遺伝子は甘いトウモロコシの低温発芽に重要な役割を果たしていると推測した。[結論]トランスクリプトームシークエンシング分析により、スイートコーンの低温発芽に関与する関連遺伝子を同定し、その後の低温発芽能力のより強いスイートコーン生殖質資源を創製するための基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *低温 ,  ドナー ,  *遺伝子 ,  *発芽 ,  交雑 ,  グルコシルトランスフェラーゼ ,  遺伝子発現 ,  アップレギュレーション ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *配列解析 ,  バイオインフォマティクス ,  生殖質 ,  自殖 ,  近交系 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： スイートコーン ,  低温 ,  発芽 ,  耐性 ,  遺伝子 ,  解析