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J-GLOBAL ID：202102288490076374   整理番号：21A2172221

市販qPCR法を用いたIsomiR識別の評価【JST・京大機械翻訳】

Assessment of isomiR Discrimination Using Commercial qPCR Methods

著者 (5件)： Magee Rogan ,  Telonis Aristeidis G. ,  Cherlin Tess ,  Rigoutsos Isidore ,  Londin Eric
資料名： Non-Coding RNA (Web)  (Non-Coding RNA (Web))
巻： 3  号： 2  ページ： 18  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7254A  ISSN： 2311-553X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 市販定量ポリメラーゼ連鎖反応(qPCR)法が,配列エンドポイント差を有する成熟マイクロRNA(miRNAs)の変異体とイソmiRを区別することができるかどうかを決定することを試みた。2つの市販のmiRNA qPCR法を用いて,合成および実際の細胞状況の両方でmiR-21-5pを定量した。これらのmiRNA qPCR法は特異的配列に対して高感度を有するが,それらはまた,個々のイソmiRの信頼できる定量に影響する密接に関連したイソmiRからバックグラウンドシグナルをピックアップすることを見いだした。これらの方法は信頼できるイソmiR定量に対して必要な特異性を持たないと結論した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 高感度 ,  *PCR法 ,  *定量的PCR法
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  非翻訳RNA ,  エンドポイント ,  特異性 ,  miR-21 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： イソミラー ,  miRNA ,  qPCR ,  短い非コードRNA

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

引用文献 (21件)：

• Bartel, D.P. MicroRNAs: Genomics, biogenesis, mechanism, and function. Cell 2004, 116, 281-297.
• Kozomara, A.; Griffiths-Jones, S. Mirbase: Annotating high confidence microRNAs using deep sequencing data. Nucleic Acids Res. 2014, 42, D68-D73.
• Bartel, D.P. MicroRNAs: Target recognition and regulatory functions. Cell 2009, 136, 215-233.
• Djuranovic, S.; Nahvi, A.; Green, R. Mirna-mediated gene silencing by translational repression followed by mrna deadenylation and decay. Science 2012, 336, 237-240.
• Cui, Q.; Yu, Z.; Purisima, E.O.; Wang, E. Principles of microrna regulation of a human cellular signaling network. Mol. Syst. Biol. 2006, 2, 46.

タイトルに関連する用語 (3件)： qPCR法 ,  識別 ,  評価