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J-GLOBAL ID：202102288598268285   整理番号：21A1376961

タイムコーストランスクリプトーム研究はArabidopsisにおける光曝露に関するbZIP転写因子のモードを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Time-Course Transcriptome Study Reveals Mode of bZIP Transcription Factors on Light Exposure in Arabidopsis

著者 (6件)： Kurihara Yukio (Synthetic Genomics Research Group, RIKEN Center for Sustainable Resource Science, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan) ,  Makita Yuko (Synthetic Genomics Research Group, RIKEN Center for Sustainable Resource Science, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan) ,  Shimohira Haruka (Synthetic Genomics Research Group, RIKEN Center for Sustainable Resource Science, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan) ,  Shimohira Haruka (Graduate School of Nanobioscience, Department of Life and Environmental System Science, Yokohama City University, Yokohama, Kanagawa 236-0027, Japan) ,  Matsui Minami (Synthetic Genomics Research Group, RIKEN Center for Sustainable Resource Science, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan) ,  Matsui Minami (Graduate School of Nanobioscience, Department of Life and Environmental System Science, Yokohama City University, Yokohama, Kanagawa 236-0027, Japan)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 21  号： 6  ページ： 1993  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 発芽後に起こる黄化過程は,一度光が知覚され,次に脱エチオレーションが始まる。脱エチオレーション期間中に,単色光(青,赤および遠赤)は,それらのそれぞれの光受容体を通して遺伝子発現プロファイルおよび植物挙動における差異を誘発する。bZIP型転写因子(TF)であるELONGATED HYPOCOTYL 5(HY5)は脱エチオレーション過程で遺伝子発現を調節し,他のbZIP TFもこの調節に関与する。しかし,単色光照射とbZIP TFsとの関係は,まだ解明されていない。ここでは,暗所に続く白色,青色,赤および遠赤光曝露後のトランスクリプトームの変化を追跡し,4種類の光間のトランスクリプトミクス変化の共有および非共有傾向を明らかにした。興味深いことに,光曝露後,HY5発現は,HY5 HOMOLOG(HYH)よりむしろ,関連するbZIP TF遺伝子,GBF2およびGBF3と同期した。bZIP TF間の標的遺伝子の冗長性を推測するために,in vitro結合アッセイを用いて7つのbZIP TF,HY5,HYH,GBF1,GBF2,GBF3,GBF4およびEELのホモ二量体のゲノムワイド物理的結合部位を調べた。結果は,標的遺伝子候補の大きな重複を明らかにし,TF間の複雑な調節文献を示した。本研究は,単色光照射に対する植物応答の遺伝子発現の調節を理解する新しい洞察を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 冗長性 ,  遺伝子 ,  発芽 ,  結合部位 ,  光受容体 ,  単色光 ,  遺伝子発現 ,  *転写因子 ,  in vitro実験 ,  *Arabidopsis ,  黄化 ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： トランスクリプトーム解析 ,  *bZIP ,  標的遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Arabidopsis ,  光 ,  トランスクリプトーム ,  HY5 ,  bZIP

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (35件)：

• Wu:, S.H. Gene expression regulation in photomorphogenesis from the perspective of the central dogma. Annu. Rev. Plant Biol. 2014, 65, 311-333.
• Paik, I.; Huq, E. Plant photoreceptors: Multi-functional sensory proteins and their signaling networks. Semin. Cell Dev. Biol. 2019, 92, 114-121.
• Gangappa, S.N.; Botto, J.F. The Multifaceted Roles of HY5 in Plant Growth and Development. Mol. Plant 2016, 9, 1353-1365.
• Chattopadhyay, S.; Ang, L.H.; Puente, P.; Deng, X.W.; Wei, N. Arabidopsis bZIP protein HY5 directly interacts with light-responsive promoters in mediating light control of gene expression. Plant Cell 1998, 10, 673-683.
• Lee, J.; He, K.; Stolc, V.; Lee, H.; Figueroa, P.; Gao, Y.; Tongprasit, W.; Zhao, H.; Lee, I.; Deng, X.W. Analysis of transcription factor HY5 genomic binding sites revealed its hierarchical role in light regulation of development. Plant Cell 2007, 19, 731-749.

タイトルに関連する用語 (5件)： 研究 ,  Arabidopsis ,  光曝露 ,  bZIP ,  転写因子