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J-GLOBAL ID：202102288830439631   整理番号：21A2816667

Pseudomonas putidaはリボソーム生合成因子を誘導し,TCAサイクル酵素を抑制することにより毒素GraTに応答する【JST・京大機械翻訳】

Pseudomonas putida Responds to the Toxin GraT by Inducing Ribosome Biogenesis Factors and Repressing TCA Cycle Enzymes

著者 (6件)： Ainelo Andres (Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, 51010 Tartu, Estonia) ,  Porosk Rando (Institute of Biomedicine and Translational Medicine, University of Tartu, 50411 Tartu, Estonia) ,  Kilk Kalle (Institute of Biomedicine and Translational Medicine, University of Tartu, 50411 Tartu, Estonia) ,  Rosendahl Sirli (Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, 51010 Tartu, Estonia) ,  Remme Jaanus (Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, 51010 Tartu, Estonia) ,  Hoerak Rita (Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, 51010 Tartu, Estonia)
資料名： Toxins (Web)  (Toxins (Web))
巻： 11  号： 2  ページ： 103  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7286A  ISSN： 2072-6651  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 潜在的に自己毒性の毒素-抗毒素モジュールは細菌染色体に広まっているが,広範な研究にもかかわらず,それらの生物学的重要性はよく理解されていない。ここでは,graA抗毒素遺伝子がゲノムから削除される時,低温依存的に増殖とリボソーム成熟を阻害することが知られているPseudomonas putida毒素GraTの細胞効果を研究するために全細胞プロテオミクスを用いた。成長がGraTにより異なる影響を受ける30Cおよび25CにおけるP.putida野生型およびΔgraA株のプロテオーム解析は,両温度でGraTに対する2つの主要な応答を明らかにした。最初に,RNAヘリカーゼDeaDとRNアーゼIIIを含むリボソーム生合成因子はΔgraAでアップレギュレートされる。これはΔgraA株のリボソーム生合成欠損を軽減するのに有用である。第2に,プロテオームデータは,TCAサイクル酵素イソクエン酸デヒドロゲナーゼIdh,-ケトグルタル酸デヒドロゲナーゼサブユニットSucA,およびコハク酸-CoAリガーゼサブユニットSucDのレベル低下により示唆されるように,GraTが中心炭素代謝のダウンレギュレーションを誘導することを示した。メタボローム分析は,25Cでのオキサロ酢酸の顕著なGraT依存性蓄積と,リンゴ酸の減少した量,別のTCA中間体を明らかにした。オキサロ酢酸の蓄積は,TCAサイクルを通して減少したフラックスによるようであるが,GraT影響細菌における同化経路の阻害も示す。したがって,ΔgraA株のプロテオームおよびメタボローム解析は,GraT媒介ストレスがGraT誘発損傷を軽減するために細胞生理学を再プログラムするいくつかの応答を誘発することを明らかにした。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *クエン酸サイクル ,  遺伝子 ,  *毒素 ,  抗毒素 ,  サブユニット ,  細胞生理 ,  *リボソーム ,  *Pseudomonas ,  *Pseudomonas putida ,  野生型 ,  ダウンレギュレーション ,  プロテオミクス ,  プロテオーム
準シソーラス用語： メタボローム ,  *リボソーム生合成 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 毒素-抗毒素系 ,  HigBAファミリーのGraTA ,  Pseudomonas putida ,  全細胞プロテオーム ,  リボソーム生合成 ,  メタボローム ,  TCAサイクル

分類 (2件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (92件)：

• Song, S.; Wood, T.K. Post-segregational killing and phage inhibition are not mediated by cell death through toxin/antitoxin systems. Front. Microbiol. 2018, 9, 814.
• Brzozowska, I.; Zielenkiewicz, U. Regulation of toxin-antitoxin systems by proteolysis. Plasmid 2013, 70, 33-41.
• Pandey, D.P.; Gerdes, K. Toxin-antitoxin loci are highly abundant in free-living but lost from host-associated prokaryotes. Nucleic Acids Res. 2005, 33, 966-976.
• Leplae, R.; Geeraerts, D.; Hallez, R.; Guglielmini, J.; Dreze, P.; Van Melderen, L. Diversity of bacterial type ii toxin-antitoxin systems: A comprehensive search and functional analysis of novel families. Nucleic Acids Res. 2011, 39, 5513-5525.
• Van Melderen, L.; Saavedra De Bast, M. Bacterial toxin-antitoxin systems: More than selfish entities? PLoS Genet. 2009, 5, e1000437.

タイトルに関連する用語 (8件)： Pseudomonas ,  リボソーム生合成 ,  因子 ,  誘導 ,  TCAサイクル ,  酵素 ,  毒素 ,  応答