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J-GLOBAL ID：202102289287715138   整理番号：21A1152078

Sahelと沿岸西アフリカからの選択されたトウモロコシ在来種のゲノム解析はそれらの可変性と遺伝的強化の可能性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genomic Analysis of Selected Maize Landraces from Sahel and Coastal West Africa Reveals Their Variability and Potential for Genetic Enhancement

著者 (9件)： Nelimor Charles (West African Science Service Centre on Climate Change and Adapted Land-use (WASCAL), Universite Felix Houphoueet Boigny, Abidjan 22 BP 461, Cote d’Ivoire) ,  Nelimor Charles (International Institute of Tropical Agriculture, Ibadan 200001, Nigeria) ,  Nelimor Charles (Department of Bioscience, Universite Felix Houphoueet Boigny, Abidjan 22 BP 461, Cote d’Ivoire) ,  Badu-Apraku Baffour (International Institute of Tropical Agriculture, Ibadan 200001, Nigeria) ,  Garcia-Oliveira Ana Luisa (Excellence in Breeding (EiB) Platform, International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), ICRAF House, Nairobi 00100, Kenya) ,  Tetteh Antonia (Department of Biochemistry and Biotechnology, Kwame Nkrumah University of Science and Technology, University Post Office Box PMP, Kumasi 00233, Ghana) ,  Paterne Agre (International Institute of Tropical Agriculture, Ibadan 200001, Nigeria) ,  N’guetta Assanvo Simon-Pierre (Department of Bioscience, Universite Felix Houphoueet Boigny, Abidjan 22 BP 461, Cote d’Ivoire) ,  Gedil Melaku (International Institute of Tropical Agriculture, Ibadan 200001, Nigeria)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 11  号： 9  ページ： 1054  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ますます予測できない気候条件へのトウモロコシの遺伝的適応は,サハラ以南のアフリカにおける食糧安全保障と持続可能な開発目標の達成にとって不可欠な必要条件である。トウモロコシの在来種;それは,改良生殖質の供給源として役立たなかった。この目的を達成するために重要な新規遺伝的変異の貴重な情報源である。本研究の全体的な目標は,208系統のトウモロコシパネルの遺伝的多様性と個体群構造を評価することであった。Burkina Faso(58),ガーナ(43),およびTogo(89)からのランドレース遺伝子プールを,国際熱帯農業研究所(IITA)のトウモロコシ改良プログラムから参照個体群(18)と共に構成した。5974のDArTseq-SNPマーカーによるトウモロコシパネルの遺伝子型決定は,平均予想ヘテロ接合性(0.36),観察されたヘテロ接合性(0.5),および多型情報量(0.29)によって示される巨大な遺伝的多様性を明らかにした。モデルベースの個体群構造;近隣結合木;主成分の判別分析;そして,主要な座標分析は,トウモロコシパネルを3つの主要な亜個体群にすべて分離した。それぞれは広範囲の対立遺伝子変異を提供できる。分子変動(AMOVA)の分析は,変異の86%が個体内であることを示した。一方,14%は遺伝子プールの違いに起因した。Burkinabe遺伝子プールは,参照個体群(Nm=0.98)への遺伝子流動(Nm)なしで,他のすべてのもの(遺伝的分化値>0.20)から強く分化した。このように;この遺伝子プールは,トウモロコシ改良のための新しい遺伝的変異の標的である。本研究の結果は,このトウモロコシパネルが,既存の育種パイプラインへのこの新規変動の移入をスピードアップするための,関連マッピング研究の将来の設計のための貴重な遺伝資源としての可能性を確認した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 情報源 ,  *遺伝 ,  気象条件 ,  育種 ,  個体群 ,  *沿岸 ,  判別分析 ,  *在来種 ,  熱帯農業 ,  遺伝資源 ,  種分化
準シソーラス用語： *ゲノミクス ,  個体群構造 ,  遺伝子流動 ,  遺伝的変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 在来種 ,  遺伝的多様性 ,  集団構造 ,  西アフリカ ,  トウモロコシの改良 ,  DArTseqマーカー

分類 (1件)： トウモロコシ  (FC03034D)

引用文献 (47件)：

• Mir, C.; Zerjal, T.; Combes, V.; Dumas, F.; Madur, D.; Bedoya, C.; Dreisigacker, S.; Franco, J.; Grudloyma, P.; Hao, P.X.; et al. Out of America: Tracing the genetic footprints of the global diffusion of maize. Theor. Appl. Genet. 2013, 126, 671-682.
• Hufford, M.B.; Lubinksy, P.; Pyhäjärvi, T.; Devengenzo, M.T.; Ellstrand, N.C.; Ross-Ibarra, J. The genomic signature of crop-wild introgression in maize. PLoS Genet. 2013, 9, e1003477.
• Warburton, M.L.; Reif, J.C.; Frisch, M.; Bohn, M.; Bedoya, C.; Xia, X.C.; Crossa, J.; Franco, J.; Hoisington, D.; Pixley, K.; et al. Genetic diversity in CIMMYT non-temperate maize germplasm: Landraces, open pollinated varieties, and inbred lines. Crop Sci. 2008, 48, 617-624.
• Yan, J.; Shah, T.; Warburton, M.L.; Buckler, E.S.; McMullen, M.D.; Crouch, J. Genetic characterization and linkage disequilibrium estimation of a global maize collection using SNP markers. PLoS ONE 2009, 4, e8451.
• Byrne, P.; Richards, C.; Volk, G.M. From wild species to landraces and cultivars. Crop Wild Relatives and their Use in Plant Breeding. In VolkGM; Byrne, P., Ed.; Colorado State University: Fort Collins, CO, USA, 2020.

タイトルに関連する用語 (9件)： Sahel ,  沿岸 ,  西アフリカ ,  トウモロコシ ,  在来種 ,  ゲノム解析 ,  可変性 ,  強化 ,  可能性