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J-GLOBAL ID：202102289295233198   整理番号：21A0280819

ダイズCurled-子葉突然変異体の全ゲノムDNAメチル化解析およびホメオドメイン-ロイシンジッパー(HD-Zip)I遺伝子GmHDZ20の機能的評価【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide DNA Methylation Analysis of Soybean Curled-Cotyledons Mutant and Functional Evaluation of a Homeodomain-Leucine Zipper (HD-Zip) I Gene GmHDZ20

著者 (12件)： Yang Hui (Innovative Center of Molecular Genetics and Evolution, School of Life Sciences, Guangzhou University, Guangzhou, China) ,  Yang Hui (National Center for Soybean Improvement, National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Jiangsu Collaborative Innovation Center for Modern Crop Production, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Yang Zhongyi (National Center for Soybean Improvement, National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Jiangsu Collaborative Innovation Center for Modern Crop Production, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Mao Zhuozhuo (National Center for Soybean Improvement, National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Jiangsu Collaborative Innovation Center for Modern Crop Production, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Li Yali (National Center for Soybean Improvement, National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Jiangsu Collaborative Innovation Center for Modern Crop Production, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Hu Dezhou (National Center for Soybean Improvement, National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Jiangsu Collaborative Innovation Center for Modern Crop Production, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Li Xiao (National Center for Soybean Improvement, National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Jiangsu Collaborative Innovation Center for Modern Crop Production, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Shi Guixia (Institute of Industrial Crops, Henan Academy of Agricultural Sciences, Zhengzhou, China) ,  Huang Fang (National Center for Soybean Improvement, National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Jiangsu Collaborative Innovation Center for Modern Crop Production, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Liu Baohui (Innovative Center of Molecular Genetics and Evolution, School of Life Sciences, Guangzhou University, Guangzhou, China) ,  Kong Fanjiang (Innovative Center of Molecular Genetics and Evolution, School of Life Sciences, Guangzhou University, Guangzhou, China) ,  Yu Deyue (National Center for Soybean Improvement, National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Jiangsu Collaborative Innovation Center for Modern Crop Production, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 11  ページ： 593999  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNAメチル化は,多くの生物学的過程に影響する主要な保存された後成的修飾である。子葉は,初期発生段階で実生に栄養を提供する特殊組織である。ダイズ(Glycine max)における発芽子葉のゲノムDNAメチル化のパターンとその子葉発達に及ぼす影響を調べるために,異常な子葉を持つダイズカール子葉(cco)変異体と全ゲノム亜硫酸水素配列決定による対応する野生型(WT)の間のDNAメチル化のゲノムワイド比較解析を行った。cco変異体はより多くの部位でメチル化されたが,全ゲノムレベルでWTよりわずかに低いレベルであった。合計46のCG-,92のCHG-,および9723のCHH-(H=A,C,またはT)特異的メチル化遺伝子(DMGs)を子葉において同定した。特に,低メチル化CHH-DMGsは遺伝子オントロジー用語「配列特異的DNA結合転写因子活性」に富んでいた。さらなる機能的特性化のためにホメオドメイン-ロイシンジッパー(HD-Zip)Iサブグループ転写因子(GmHDZ20)をコードするDMGを選択した。GmHDZ20は核に局在し,葉と子葉組織で高度に発現した。Arabidopsis thalianaにおけるGmHDZ20の構成的発現は,鋸歯状ロゼット葉,より短いシリーク,およびシラク当たりの種子数の減少をもたらした。酵母2ハイブリッドアッセイは,GmHDZ20が植物成長の複数の側面と関連する3つの蛋白質と物理的に相互作用することを明らかにした。まとめると,著者らの結果は正常および異常子葉におけるダイズDNAメチル化の包括的な研究を提供し,子葉発達に関与する特異的DMGの同定に有用で,ダイズにおけるGmHDZ20の将来の詳細な機能的研究の基礎も提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *メチル化 ,  *遺伝子 ,  酵母 ,  *子葉 ,  *ダイズ ,  タンパク質 ,  発芽 ,  *ゲノム ,  実生 ,  野生型 ,  転写因子 ,  Arabidopsis thaliana
準シソーラス用語： *DNAメチル化 ,  *ロイシンジッパー ,  *ホメオドメイン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ダイズ ,  カール子葉 ,  変異体 ,  DNAメチル化 ,  GmHDZ20

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (83件)：

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• AlbrechtV.IngenfeldA.ApelK. (2006). Characterization of the snowy cotyledon 1 mutant of Arabidopsis thaliana: the impact of chloroplast elongation factor G on chloroplast development and plant vitality. Plant Mol. Biol. 60 507-518. doi: 10.1007/s11103-005-4921-0 16525888
• AnY. C.GoettelW.HanQ.BartelsA.LiuZ.XiaoW. (2017). Dynamic Changes of Genome-Wide DNA methylation during soybean seed development. Sci. Rep. 7 12263-12263. doi: 10.1038/s41598-017-12510-4 28947812
• AnZ.LiuY.OuY.LiJ.ZhangB.SunD. (2018). Regulation of the stability of RGF1 receptor by the ubiquitin-specific proteases UBP12/UBP13 is critical for root meristem maintenance. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 115 1123-1128. doi: 10.1073/pnas.1714177115 29339500
• AoyamaT.DongC. H.WuY.CarabelliM.SessaG.RubertiI. (1995). Ectopic expression of the Arabidopsis transcriptional activator Athb-1 alters leaf cell fate in tobacco. Plant Cell 7 1773-1785. doi: 10.1105/tpc.7.11.1773 8535134

タイトルに関連する用語 (11件)： ダイズ ,  子葉 ,  突然変異体 ,  ゲノム ,  DNAメチル化 ,  解析 ,  ホメオドメイン ,  ロイシンジッパー ,  HD ,  遺伝子 ,  機能的評価