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J-GLOBAL ID：202102290895208069   整理番号：21A3307187

非標識樹木の周辺構造と倍数体の進化におけるサブゲノムの蓄積【JST・京大機械翻訳】

Peripheral structures in unlabelled trees and the accumulation of subgenomes in the evolution of polyploids

著者 (2件)： Pouryahya Fatemeh (Department of Mathematics and Statistics, University of Ottawa, 150 Louis Pasteur Pvt, Ottawa K1N 6N5, Canada) ,  Sankoff David (Department of Mathematics and Statistics, University of Ottawa, 150 Louis Pasteur Pvt, Ottawa K1N 6N5, Canada)
資料名： Journal of Theoretical Biology  (Journal of Theoretical Biology)
巻： 532  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： A0288B  ISSN： 0022-5193  CODEN： JTBIA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くの被子植物は,それらの進化史の経過にわたって,いくつかの系列の倍数体化事象を受けた。これらのゲノムにおいて,特に多重自己倍数体化から生じるそれらでは,nホメオロガス染色体のすべてのξセットを認識するのが比較的容易であるかもしれないが,これらの染色体をnサブゲノムに分割するのは,それぞれ,元の倍数体を構成するξ染色体の1つの異なるゲノム成分を表す。したがって,ゲノムの倍数体化の歴史を推論するならば,著者らは,コンセンサスツリーを構築するために,1セットのホメオロガス染色体の遺伝子から推論されたすべての遺伝子木を用いることができるが,これらのセットを通して一致することが知られている染色体の標識を持たないので,ξの異なるセットから樹木を結合する明白な方法は存在しない。ここでは,一貫した葉標識を欠くと,樹木のトポロジー構造が十分な類似性を示し,より高いレベルのコンセンサスが進化の歴史を明らかにすることができることを示唆する。これは,樹木の周辺構造,特により最近起こった事象を表し,その後の進化過程により不明瞭な現象を示す。ここでは,倍数体ゲノムのサブゲノムが一度に追加できるかどうかを評価するための統計的試験を提示する。ヌル仮説は,染色体の蓄積が,1世代から次のものへの移行がエッジをランダムに選択することを通して,新しい外部頂点に新しい内部頂点をリンクするためにこのエッジを分割する確率過程に従うということである。著者らは,いくつかの正確な再発に関して,この確率過程から生じる,葉-または末端-対,三重および四重項の多数の周辺木下部構造の確率分布を解析した。これらの分布の漸近挙動に関するいくつかの予測を提案した。サトウキビゲノムに本解析を適用して,サブゲノムの蓄積が1時間において起こる可能性はそうではないことを示した。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 位相幾何学 ,  確率過程 ,  確率分布 ,  遺伝子 ,  サトウキビ ,  染色体 ,  被子植物 ,  系統発生 ,  *ゲノム ,  多重化 ,  *倍数体 ,  漸近挙動 ,  四重項
準シソーラス用語： 倍数体化 ,  進化史 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 非標識木 ,  再発 ,  倍数体化 ,  植物系統発生 ,  比較ゲノミクス ,  周辺構造

分類 (1件)： 進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： 標識 ,  樹木 ,  周辺 ,  倍数体 ,  進化 ,  サブ ,  ゲノム ,  蓄積