文献

J-GLOBAL ID：202102291202186375   整理番号：21A2841920

ABCアッセイ:ヨーロッパミツバチの越冬コロニー損失における3つのDWVマスター変異体の役割を定量化するための方法開発と応用【JST・京大機械翻訳】

ABC Assay: Method Development and Application to Quantify the Role of Three DWV Master Variants in Overwinter Colony Losses of European Honey Bees

著者 (8件)： Kevill Jessica L. (School of Environment and Life Sciences, The University of Salford, Manchester M5 4WT, UK) ,  Highfield Andrea (Viral Ecology, Marine Biological Association, Plymouth PL1 2PB, UK) ,  Mordecai Gideon J. (Viral Ecology, Marine Biological Association, Plymouth PL1 2PB, UK) ,  Mordecai Gideon J. (Department of Earth, Ocean and Atmospheric Sciences and Biodiversity Research Centre, The University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 1Z4, Canada) ,  Martin Stephen J. (School of Environment and Life Sciences, The University of Salford, Manchester M5 4WT, UK) ,  Schroeder Declan C. (Viral Ecology, Marine Biological Association, Plymouth PL1 2PB, UK) ,  Schroeder Declan C. (School of Biological Sciences, University of Reading, Reading RG6 6LA, UK) ,  Schroeder Declan C. (Veterinary Population Medicine, College of Veterinary Medicine, University of Minnesota, St Paul, MN 55108, USA)
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 9  号： 11  ページ： 314  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 変形翼ウイルス(DWV)は世界で最も流行しているミツバチウイルス病原体の1つである。多くのRNAウイルスの典型であるDWVは,現在3つのマスター変異体:タイプA,B,およびCから成る多数の異なる変異体から成る準種である。個々の宿主の生物学に及ぼす各変異体または変異体の組合せの影響についてはほとんど知られていない。したがって,マスター変異体特異的DWVプライマーの新しいセットとマスター変異体のそれぞれの定量化を可能にする一連の標準を開発した。競合的逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)実験計画は,各新しいDWVプライマーセットが遡及的マスター変異体に特異的であることを確認した。ABCアッセイの感受性は,DNAまたはRNAが鋳型として使用され,他のマスター変異体が試料中に存在するかどうかに依存する。次世代配列(NGS)データによって確認されるように,既知多様性のサンプル内の各マスター変異体の全体的割合の比較は,ABCアッセイの効率を検証した。ABCアッセイを,Devon越冬コロニー損失(OCL)2006-2007研究からの保存材料に使用した;さらに,DWVタイプAと,おそらく蜂蜜ハチコロニーの非時間崩壊におけるCを暗示する。さらに,本研究では,DWV型BはOCLと関連していなかった。ABCアッセイの使用は,蜂蜜ハチにおけるDWVマスター変異体の存在に対して,研究者を迅速かつ費用効果的にプレスクリーニングすることを可能にする。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 実験計画法 ,  DNA【核酸】 ,  RNA【核酸】 ,  感受性 ,  蜂蜜 ,  RNAウイルス ,  *ミツバチ ,  *コロニー ,  病原体 ,  *越冬 ,  *セイヨウミツバチ ,  RT-PCR法 ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： 費用対効果 ,  タイプA行動パターン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 変形翼ウイルス ,  準種 ,  ミツバチ ,  RT-qPCR ,  越冬コロニー損失 ,  超感染排除

分類 (1件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

引用文献 (42件)：

• Domingo, E.; Holland, J.J. RNA virus mutations and fitness for survival. Annu. Rev. Microbiol. 1997, 51, 151-178.
• Biebricher, C.; Eigen, M. What is a quasispecies? In Quasispecies: Concept and Implications for Virology; Springer: Berlin/Heidelberg, Germany, 2006; pp. 1-31.
• Lauring, A.S.; Andino, R. Quasispecies theory and the behavior of RNA viruses. PLoS Pathog. 2010, 6, e1001005.
• Domingo, E.; Sheldon, J.; Perales, C. Viral quasispecies evolution. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2012, 76, 159-216.
• Baker, A.C.; Schroeder, D.C. The use of RNA-dependent RNA polymerase for the taxonomic assignment of Picorna-like viruses (order Picornavirales) infecting Apis mellifera L. populations. Virol. J. 2008, 5, 10.

タイトルに関連する用語 (12件)： ABC ,  アッセイ ,  ヨーロッパミツバチ ,  越冬 ,  コロニー ,  損失 ,  マスター ,  変異体 ,  役割 ,  定量化 ,  開発 ,  応用