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J-GLOBAL ID：202102291243259586   整理番号：21A0874369

高品質小角X線散乱(SAXS)データを得るためのサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)と光散乱(LS)装置【JST・京大機械翻訳】

Adding Size Exclusion Chromatography (SEC) and Light Scattering (LS) Devices to Obtain High-Quality Small Angle X-Ray Scattering (SAXS) Data

著者 (7件)： Graewert Melissa A. ,  Vela Stefano Da ,  Graewert Tobias W. ,  Molodenskiy Dmitry S. ,  Blanchet Clement E. ,  Svergun Dmitri I. ,  Jeffries Cy M.
資料名： Crystals (Web)  (Crystals (Web))
巻： 10  号： 11  ページ： 975  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7169A  ISSN： 2073-4352  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 著者らは,PETRAIIIシンクロトロン,DESY Hamburg(ドイツ)における欧州分子生物学研究所(EMBL)のP12バイオSAXSビームラインで使用される最新のサイズ排除クロマトグラフィー小角X線散乱(SEC-SAXS)セットアップを記述する。SAXSキャピラリーへの直接オンラインでのサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)の添加は,SAXS測定に対する試料の不均一性の影響を低減するための確立されたアプローチになった。SAXS測定と平行して,多重角度レーザ光散乱(MALLS),UV吸収分光法,屈折率(RI)および準弾性光散乱(QELS)の追加使用は,独立した分子量検証および流体力学的半径推定を可能にした。これは,試料の単分散性ならびに立体配座の不均一性に対処することができる。現在のSEC-SAXSセットアップの利点を,選択した標準蛋白質セットで実証した。処理したSEC-SAXSデータおよびモデルを,小角散乱生物学的データバンク(SASBDB)で提供し,それぞれのSEC溶出プロファイルおよび対応するMALLS-UV-RI-QELSデータにわたる非減算データフレームを含むベンチマーキングデータセットとしてラベル付けした。これらのエントリは,SASデータ解析とモデリングのための教育資源に加えて,試験目的に適したデータセットを有する開発者を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 屈折率 ,  シンクロトロン ,  *光散乱 ,  立体配座 ,  データベース ,  弾性 ,  分子量 ,  タンパク質 ,  多重化 ,  小角散乱 ,  減算 ,  *小角X線散乱 ,  *サイズ排除クロマトグラフィー ,  溶出
準シソーラス用語： 単分散 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 小角X線散乱 ,  サイズ排除クロマトグラフィー ,  レーザ光散乱 ,  データ品質 ,  ベンチマークされたデータセット ,  SASBDB

分類 (1件)： 高分子の分子量分布,分別  (CG02032X)

引用文献 (40件)：

• Tuukkanen, A.T.; Spilotros, A.; Svergun, D.I. Progress in small-angle scattering from biological solutions at high-brilliance synchrotrons. IUCrJ 2017, 4, 518-528.
• Bernadó, P.; Shimizu, N.; Zaccai, G.; Kamikubo, H.; Sugiyama, M. Solution scattering approaches to dynamical ordering in biomolecular systems. Biochim. Biophys. Acta BBA Gen. Subj. 2018, 1862, 253-274.
• Vallat, B.; Webb, B.; Westbrook, J.; Sali, A.; Berman, H.M. Development of a prototype system for archiving integrative/hybrid structure models of biological macromolecules. Structure 2018, 26, 894-904.
• Brosey, C.A.; Tainer, J.A. Evolving SAXS versatility: Solution X-ray scattering for macromolecular architecture, functional landscapes, and integrative structural biology. Curr. Opin. Struct. Biol. 2019, 58, 197-213.
• Jeffries, C.M.; Graewert, M.A.; Blanchet, C.E.; Langley, D.B.; Whitten, A.E.; Svergun, D.I. Preparing monodisperse macromolecular samples for successful biological small-angle X-ray and neutron-scattering experiments. Nat. Protoc. 2016, 11, 2122-2153.

タイトルに関連する用語 (5件)： 高品質 ,  小角X線散乱 ,  SAXS ,  サイズ排除クロマトグラフィー ,  光散乱