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J-GLOBAL ID：202102291812206028   整理番号：21A1432951

Geobacillus spp.の汎ゲノム分析は遺伝的特性と堆肥化可能性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Pan-Genome Analyses of Geobacillus spp. Reveal Genetic Characteristics and Composting Potential

著者 (7件)： Wang Mengmeng ,  Zhu Han ,  Kong Zhijian ,  Li Tuo ,  Ma Lei ,  Liu Dongyang ,  Shen Qirong
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 21  号： 9  ページ： 3393  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Geobacillus属は,生態学的多様性において豊富であり,また,種々の熱安定性酵素を生産するための著者の供給源としてよく知られている。GeobacillusがBacillusから進化したことは明らかであるが,その進化メカニズムに関しては,その生態学的多様性とバイオテクノロジーの可能性にも寄与する可能性がある。ここでは,32のGeobacillusゲノムの統計的比較を,パンおよびコアゲノムに関する特異的焦点で実施した。Geobacillus株のこのセットのパンゲノムは14,913遺伝子を含み,コアゲノムは940遺伝子を含んでいた。オルソロガスグループ(COG)と炭水化物活性酵素(CAZymes)分析のクラスタは,Geobacillus菌株が農業廃棄物管理のための堆肥化において巨大な潜在的産業応用を有することを明らかにした。詳細な比較分析は,塩基性機能クラスとハウスキーピング遺伝子がコアゲノムで保存され,一方,環境相互作用またはエネルギー代謝に関連する遺伝子がパンゲノムでより豊富であることを示した。したがって,Geobacillusの進化は環境パラメータによって誘導されるようである。さらに,異なるGeobacillus種間の水平遺伝子導入(HGT)事象を検出した。まとめると,パンゲノム分析は進化メカニズムを検出する有用な方法であり,Geobacillusの進化は環境とHGT事象によって指示された。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  農業廃棄物 ,  酵素 ,  *遺伝 ,  遺伝子 ,  エネルギー代謝 ,  *ゲノム ,  *堆肥化 ,  桿菌属 ,  クラスタ ,  生態学 ,  塩基性 ,  ハウスキーピング遺伝子
準シソーラス用語： 遺伝子水平移動 ,  比較ゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Geobacillus ,  比較ゲノミクス ,  パンゲノム ,  コアゲノム ,  ゲノム特徴 ,  進化イベント

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (59件)：

• Zeigler, D.R. The Geobacillus paradox: Why is a thermophilic bacterial genus so prevalent on a mesophilic planet? Microbiology 2014, 160, 1-11.
• Studholme, D.J. Some (bacilli) like it hot: Genomics of Geobacillus species. Microb. Biotechnol. 2015, 8, 40-48.
• Hussein, A.H.; Lisowska, B.K.; Leak, D.J. The genus Geobacillus and their biotechnological potential. In Advances in Applied Microbiology; Elsevier: Wallingford, UK, 2015; Volume 92, pp. 1-48.
• Bartosiak-Jentys, J.; Hussein, A.H.; Lewis, C.J.; Leak, D.J. Modular system for assessment of glycosyl hydrolase secretion in Geobacillus thermoglucosidasius. Microbiology 2013, 159, 1267-1275.
• Suzuki, H.; Okazaki, F.; Kondo, A.; Yoshida, K. Genome mining and motif modifications of glycoside hydrolase family 1 members encoded by Geobacillus kaustophilus HTA426 provide thermostable 6-phospho-β-glycosidase and β-fucosidase. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2013, 97, 2929-2938.

タイトルに関連する用語 (5件)： Geobacillus ,  SPP ,  遺伝 ,  堆肥化 ,  可能性