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J-GLOBAL ID：202102293319192029   整理番号：21A0294955

結腸直腸癌における腸内フローラ関連キー遺伝子と治療薬の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of intestinal flora-related key genes and therapeutic drugs in colorectal cancer

著者 (6件)： Zhang Jiayu (Department of Gastrointestinal Colorectal and Anal Surgery, China-Japan Union Hospital of Jilin University, Changchun, China) ,  Zhang Huaiyu (Department of Gastrointestinal Colorectal and Anal Surgery, China-Japan Union Hospital of Jilin University, Changchun, China) ,  Li Faping (Department of Urology, The First Hospital of Jilin University, Changchun, China) ,  Song Zheyu (Department of Gastrointestinal Colorectal and Anal Surgery, China-Japan Union Hospital of Jilin University, Changchun, China) ,  Li Yezhou (Department of Vascular Surgery, China-Japan Union Hospital of Jilin University, Changchun, China) ,  Zhao Tiancheng (Department of Endoscopy Center, China-Japan Union Hospital of Jilin University, Changchun, China)
資料名： BMC Medical Genomics (Web)  (BMC Medical Genomics (Web))
巻： 13  号： 1  ページ： 1-8  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7308A  ISSN： 1755-8794  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 結腸直腸癌(CRC)は多因子腫瘍であり,世界的に癌特異的死の主因である。最近の研究は,腸内フローラの変化がCRCの発生に寄与することを示した。しかし,腸内フローラがCRCの病因に影響する分子機構は不明である。本研究は,CRCのCRCと治療薬に対する腸内フローラの影響の根底にある重要な遺伝子を調査することを目的とする。腸内フローラ関連遺伝子をテキストマイニングを用いて決定した。癌ゲノムAtlasデータベースに基づいて,CRCと正常試料間の差次的発現遺伝子(DEG)をRソフトウェアのlimmaパッケージにより同定した。次に,2つの遺伝子セットの交差を,注釈,可視化および統合発見のためのツールデータベースを用いて濃縮分析のために選択した。蛋白質相互作用ネットワーク分析を,STRINGとサイトスコープを用いて重要な遺伝子を同定するために実行した。CRC患者の全生存と鍵遺伝子の相関を分析した。最後に,重要な遺伝子を,CRCを治療するための薬物候補を見つけるために,薬剤-グラフェン相互作用データベースに対して質問した。腸のフローラに関連する518の遺伝子を,テキストマイニングによって決定した。癌ゲノムAtlasデータベースに基づいて,CRCにおける25の上方制御と23の下方制御されたDEGを含む腸内フローラに関連する48のDEGを同定した。濃縮分析は,選択した遺伝子が,主に細胞-細胞シグナリング,免疫反応,サイトカイン-サイトカイン受容体相互作用およびJAK-STATシグナリング経路に関わることを示した。蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークを,13のノードと35の端部で構築した。さらに,有意なクラスターの8つの遺伝子は,重要な遺伝子として考慮され,ケモカイン(C-X-Cモチーフ)リガンド8(CXCL8)は,CRC患者の全生存と正相関した。最後に,薬剤-Gene相互作用データベースを用いたCRC治療に対する可能な薬剤として合計24の薬物を予測した。本研究の知見はCRCの病因と治療に新しい洞察を提供するかもしれない。薬物-遺伝子相互作用の予測は,新薬または既存薬物のための新規標的を探索するための大きな実用的意義がある。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  データベース ,  ネットワーク ,  *遺伝子 ,  免疫反応 ,  可視化 ,  クラスタ ,  ソフトウェア ,  *フローラ ,  アップレギュレーション ,  大腸腫瘍 ,  ケモカイン ,  病因
準シソーラス用語： テキストマイニング ,  *結腸直腸癌 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 大腸癌 ,  腸内フローラ ,  テキストマイニング ,  重要な遺伝子 ,  薬物

分類 (2件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (41件)：

• CA Cancer J Clin; Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries; F Bray, J Ferlay, I Soerjomataram, RL Siegel, LA Torre, A Jemal; 68; 6; 2018; 394-424; 10.3322/caac.21492; citation_id=CR1
• Mol Aspects Med; Circulating biomarkers for early detection and clinical management of colorectal cancer; M Marcuello, V Vymetalkova, RPL Neves, S Duran-Sanchon, HM Vedeld, E Tham; 69; 2019; 107-122; 10.1016/j.mam.2019.06.002; citation_id=CR2
• Chen EX, Jonker DJ, Loree JM, Kennecke HF, Berry SR, Couture F et al. Effect of Combined immune checkpoint inhibition vs. best supportive care alone in patients with advanced colorectal cancer: The Canadian Cancer Trials Group CO.26 Study. JAMA Oncol 2020, 6(6):831-838.
• Metastatic Colorectal Cancer Clin Cancer Res; Phase II study of ensituximab, a novel chimeric monoclonal antibody, in adults with unresectable; RD Kim, NS Azad, MA Morse, E Poplin, A Mahipal, B Tan; 26; 14; 2020; 3557-3564; citation_id=CR4
• Front Oncol; Collagen kinase receptors as potential therapeutic targets in metastatic colon cancer; M Lafitte, A Sirvent, S Roche; 10; 2020; 125; 10.3389/fonc.2020.00125; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (6件)： 結腸直腸癌 ,  腸内フローラ ,  キー ,  遺伝子 ,  治療薬 ,  同定