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J-GLOBAL ID：202102293922606289   整理番号：21A0092090

表現型および分子マーカー解析は草Stenotaphrum secundatumの遺伝的多様性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Phenotypic and molecular marker analysis uncovers the genetic diversity of the grass Stenotaphrum secundatum

著者 (19件)： Luo Ying (Key Laboratory of Genetics and Germplasm Innovation of Tropical Special Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of Education/Engineering Research Center of Rare and Precious Tree Species in Hainan Province, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Luo Ying (Hainan Biological Key Laboratory for Germplasm Resources of Tropical Special Ornamental Plants, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Zhang Xiujie (Key Laboratory of Genetics and Germplasm Innovation of Tropical Special Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of Education/Engineering Research Center of Rare and Precious Tree Species in Hainan Province, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Zhang Xiujie (Hainan Biological Key Laboratory for Germplasm Resources of Tropical Special Ornamental Plants, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Xu Jiahong (Key Laboratory of Genetics and Germplasm Innovation of Tropical Special Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of Education/Engineering Research Center of Rare and Precious Tree Species in Hainan Province, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Xu Jiahong (Hainan Biological Key Laboratory for Germplasm Resources of Tropical Special Ornamental Plants, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Zheng Yao (Key Laboratory of Genetics and Germplasm Innovation of Tropical Special Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of Education/Engineering Research Center of Rare and Precious Tree Species in Hainan Province, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Zheng Yao (Hainan Biological Key Laboratory for Germplasm Resources of Tropical Special Ornamental Plants, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Pu Shouqin (Key Laboratory of Genetics and Germplasm Innovation of Tropical Special Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of Education/Engineering Research Center of Rare and Precious Tree Species in Hainan Province, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Pu Shouqin (Hainan Biological Key Laboratory for Germplasm Resources of Tropical Special Ornamental Plants, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Duan Zhizhen (Key Laboratory of Genetics and Germplasm Innovation of Tropical Special Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of Education/Engineering Research Center of Rare and Precious Tree Species in Hainan Province, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Duan Zhizhen (Hainan Biological Key Laboratory for Germplasm Resources of Tropical Special Ornamental Plants, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Li Zhihao (Key Laboratory of Genetics and Germplasm Innovation of Tropical Special Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of Education/Engineering Research Center of Rare and Precious Tree Species in Hainan Province, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Li Zhihao (Hainan Biological Key Laboratory for Germplasm Resources of Tropical Special Ornamental Plants, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Liu Guodao (Chinese Academy of Tropical Agricultural Science, Haikou, People’s Republic of China) ,  Chen Jinhui (Key Laboratory of Genetics and Germplasm Innovation of Tropical Special Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of Education/Engineering Research Center of Rare and Precious Tree Species in Hainan Province, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Chen Jinhui (Hainan Biological Key Laboratory for Germplasm Resources of Tropical Special Ornamental Plants, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Wang Zhiyong (Key Laboratory of Genetics and Germplasm Innovation of Tropical Special Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of Education/Engineering Research Center of Rare and Precious Tree Species in Hainan Province, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China) ,  Wang Zhiyong (Hainan Biological Key Laboratory for Germplasm Resources of Tropical Special Ornamental Plants, College of Forestry, Hainan University, Haikou, People’s Republic of China)
資料名： BMC Genetics (Web)  (BMC Genetics (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-12  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7366A  ISSN： 1471-2156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Stenotaphrum secundatumは,豊富な品種を持つ重要な草であり,経済的に貴重な作物としての開発に大きな可能性がある。しかし,S.secundatumの遺伝的多様性についてはほとんど知られていない。ここでは,S.secundatum生殖質資源の,更なる保存,利用,および分類のための理論的基礎を提供するために,著者らは,49のS.secundatum系統の遺伝的多様性を分析するために,表現型および分子マーカー(一塩基多型,SNP;配列関連増幅多型,SRAP;単純配列反復,ISSR)を使用した。7種類の表現型データに基づいて,49のS.secundatum系統は,大きな変動で3つのクラスに分けることができた。49のアクセッションにおいて1280,873のSNPを同定し,そのうち66.22%は遷移SNPであり,33.78%はトランスバージョンSNPであった。これらの中で,C/Tは最も一般的(19.12%)で,G/Cは最小頻度(3.68%)であった。28のSRAPプライマーを用いて,267の多型バンドを増幅した273バンドから検出した。さらに,27のISSRマーカーは527の増幅バンドを生成し,その全ては多型であった。両マーカータイプは高レベルの遺伝的多様性を示し,ISSRマーカーはSRAPマーカー(97.8%)よりも高い多型遺伝子座(100%)を示した。SRAPマーカー(h=0.47,I=0.66)およびISSRマーカー(h=0.45,I=0.64)に基づく系統の遺伝的多様性は,S.secundatum系統が高度に多様であるという概念を支持する。S.secundatumは,評価した分子マーカーに基づいて3つのクラスに分けることができた。SNP,SRAPおよびISSRマーカーを用いた表現型および分子マーカー分析は,S.secundatum系統間で大きな遺伝的変異を明らかにし,3つのクラスに一貫して分割された。著者らの知見は,S.secundatumの遺伝的多様性と分類の理論的基礎を提供する。著者らの結果は,SNP,SRAPおよびISSRマーカーが,S.secundatumにおける遺伝的多様性を分析するために信頼できて有効であることを示している。本研究で同定されたSNPは,S.secundatum系統を区別するために使用できた。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 農作物 ,  *表現型 ,  品種 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： *Stenotaphrum ,  *分子マーカー ,  ISSR ,  遺伝的変異 ,  生殖質 ,  SRAP ,  *遺伝多様性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Stenotaphrum secundatum ,  表現型 ,  分子マーカー ,  単一ヌクレオチド多型 ,  遺伝的多様性

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (48件)：

• The flora of China; 2006; CR1; S Chen, SM Phillips; citation_publisher=Science Press Beijing
• Crop Sci; Genetic diversity and vulnerability of St. Augustinegrass; P Busey; 35; 2; 1995; 322; 10.2135/cropsci1995.0011183X003500020005x; citation_id=CR2
• HortScience; Wilt avoidance in St. Augustinegrass germplasm; P Busey; 31; 7; 1996; 1135; 10.21273/HORTSCI.31.7.1135; citation_id=CR3
• Plant Dis; Susceptibility of St. Augustinegrass germplasm to Pyricularia grisea; RA Atilano, P Busey; 67; 7; 1983; 782; 10.1094/PD-67-782; citation_id=CR4
• Huang J, Xia HP, Yang BB. Introduction of a new warm-season turfgrass- Stenotaphrum helferi Munro. Grassland Turf. 2004. https://doi.org/10.3969/j.issn.1009-5500.2004.02.017.

タイトルに関連する用語 (5件)： 表現型 ,  分子マーカー ,  解析 ,  草 ,  遺伝的多様性