AlphaFold DB: AlphaFold Protein Structure Database

保有機関：

EMBL-EBI

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (1件)：タンパク質

タグ【データの種類】 (1件)： 3D構造

生物種 (21件)： Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702) , Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) , Candida albicans (NCBI Taxonomy ID: 5476) , Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) , Dictyostelium discoideum (NCBI Taxonomy ID: 44689) , Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) , Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562) , Glycine max (NCBI Taxonomy ID: 3847) , Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Leishmania infantum (NCBI Taxonomy ID: 5671) , Methanocaldococcus jannaschii (NCBI Taxonomy ID: 2190) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Mycobacterium tuberculosis (NCBI Taxonomy ID: 1773) , Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530) , Plasmodium falciparum (NCBI Taxonomy ID: 5833) , Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) , Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932) , Schizosaccharomyces pombe (NCBI Taxonomy ID: 4896) , Staphylococcus aureus (NCBI Taxonomy ID: 1280) , Trypanosoma cruzi (NCBI Taxonomy ID: 5693) , Zea mays (NCBI Taxonomy ID: 4577)

概要：

AlphaFoldによって予測されたタンパク質の3次元構造を収録したデータベースです。各タンパク質について、UniProtから取得した基本情報とアミノ酸配列、残基ごとの信頼性メトリック(pLDDT)で色分けされたインタラクティブな3次元座標ビューワー(側鎖を含む)、タンパク質のドメイン会合や大規模トポロジーの信頼性を評価するための予測整列エラー(Predicted aligned error)を収録しています。タンパク質名、遺伝子名、UniProt ID、生物種による検索が可能です。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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