資源
J-GLOBAL ID：202110010614838144
研究資源コード：NBDC02579
更新日：2021年08月24日
ncRNA-eQTL
ncRNA-eQTL
保有機関：
-
Huazhong Agricultural University, College of Informatics
資源分類：
データ・データベース
タグ【対象】 (4件)：
ゲノム/遺伝子
, RNA
, 遺伝的多様性
, 健康/疾患
タグ【データの種類】 (4件)：
配列
, 発現
, 表現型
, 相互作用/パスウェイ
生物種 (1件)：
Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
概要：
ヒトのncRNA(non-coding RNA)発現に影響を与えるSNPに関する情報のデータベースです。TCGA (The Cancer Genome Atlas) のデータから、33種類のがんそれぞれについて、ncRNA発現量に関連すると特定されたeQTLと影響を受ける遺伝子のペアの位置、アレルごとの発現量分布、相関係数、P値などが収録されています。患者の寿命やGWASの連鎖不平衡と関係のあるeQTLも収録されており、がんの種類、Gene ID、SNP IDから各データを検索しダウンロードすることが可能です。
作成機関：
NBDC
レコード管理者：
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件：
Creative Commons CC0 license
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