oRNAment: o RNA motifs enrichment in complete transcriptomes

保有機関：

Lécuyer Lab, Institut de Recherches Cliniques de Montéral

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (3件)：ゲノム/遺伝子 , RNA , タンパク質

タグ【データの種類】 (3件)：配列 , 分類 , 相互作用/パスウェイ

生物種 (5件)： Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) , Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) , Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090)

概要：

ヒトやマウスなど5種類の生物のRNA結合タンパク質の推定結合ドメインのデータベースです。各RNA結合タンパク質について、生物種、コードする遺伝子名、モチーフ名、モチーフのゲノム上の位置情報、種特異性の有無、標準モチーフとの配列類似性スコアなどのデータが収録されています。データは、生物種、RNA結合タンパク質名、遺伝子やmRNAの性質、配列の存在領域から検索可能で、検索結果およびすべてのデータをダウンロードすることができます。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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