川口茜

カワグチアカネ | Kawaguchi Akane

所属機関・部署：
職名：助教

研究分野 (1件)：発生生物学

研究キーワード (9件)：ゲノム配列・シス調節配列の種間における多様性 , HOXs , 位置情報の記憶 , 四肢再生 , 器官再生 , エピゲノム制御(ヒストン修飾’・三次元クロマチン構造) , 眼発生・Pax6・レンズ発生・PPE , 器官発生 , 遺伝子発現制御

競争的資金等の研究課題 (11件)：

2023 - 2026 発生的拘束を生み出す染色体立体構造に比較クロマチン解析から迫る
2023 - 2025 再生とがんを司る多階層な高次染色体構造による転写調節機構の解明
2023 - 2024 非モデル動物の染色体三次元構造の制御と進化的制約
2023 - 2024 細胞移動の生物学的意義を問う〜ストレスが生殖細胞の核に与えるインパクト〜
2023 - 2024 海洋から汽水へ : 脊椎動物の生息領域拡大戦略をゲノム制御から理解する

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論文 (16件)：

Kiyo Sakagami, Takeshi Igawa, Kaori Saikawa, Yusuke Sakaguchi, Nusrat Hossain, Chiho Kato, Kazuhito Kinemori, Nanoka Suzuki, Makoto Suzuki, Akane Kawaguchi, et al. Development of a heat-stable alkaline phosphatase reporter system for cis-regulatory analysis and its application to 3D digital imaging of Xenopus embryonic tissues. Development, growth & differentiation. 2024
Aoi Otsuka, Katsuhiko Minami, Koichi Higashi, Akane Kawaguchi, Sachiko Tamura, Satoru Ide, Michael J. Hendzel, Ken Kurokawa, Kazuhiro Maeshima. Chromatin organization and behavior in HRAS-transformed mouse fibroblasts. Chromosoma. 2023
Reimi Tada, Takuya Higashidate, Takanori Amano, Shoma Ishikawa, Chifuyu Yokoyama, Suzu Kobari, Saki Nara, Koshiro Ishida, Akane Kawaguchi, Haruki Ochi, et al. The shh limb enhancer is activated in patterned limb regeneration but not in hypomorphic limb regeneration in Xenopus laevis. Developmental Biology. 2023. 500. 22-30
Hannah Schmidbaur, Akane Kawaguchi, Tereza Clarence, Xiao Fu, Oi Pui Hoang, Bob Zimmermann, Elena A Ritschard, Anton Weissenbacher, Jamie S Foster, Spencer V Nyholm, et al. Emergence of novel cephalopod gene regulation and expression through large-scale genome reorganization. Nature communications. 2022. 13. 1. 2172-2172
Osamu Nishimura, John Rozewicki, Kazuaki Yamaguchi, Kaori Tatsumi, Yuta Ohishi, Tazro Ohta, Masaru Yagura, Taiki Niwa, Chiharu Tanegashima, Akinori Teramura, et al. Squalomix: shark and ray genome analysis consortium and its data sharing platform. F1000Research. 2022. 11. 1077-1077

MISC (12件)：

川口茜. DNAの核内立体構造を捉える. 月刊「細胞」. 2023. 55. 2
Akane Kawaguchi, Elly M Tanaka. Chromosome Conformation Capture for Large Genomes. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2023. 2562. 291-318
荻野肇, 越智陽城, 川口茜. ゲノム倍加後のコード配列進化におけるエンハンサー減衰変異の促進的役割. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2016. 39th
川口茜, 越智陽城, 須藤則広, 荻野肇. ヒストン脱メチル化因子Jmjd3による眼形成遺伝子pax6の発現制御. 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集. 2015. 87th
Akane Kawaguchi, Haruki Ochi, Hajime Ogino. The H3K27 demethylase, Jmjd3, is essential for activation of pax6 during eye development. GENES & GENETIC SYSTEMS. 2015. 360. 6. 360

講演・口頭発表等 (18件)：

巨大染色体の相互作用地図から我々は何を学ぶのか:染色体制御の普遍性と特殊進化の理解に挑む
(学変(B) 性染色体サイクル: 第一回領域班会議 2023)
アホロートルから再生四肢再生能力を学ぶ
(オンラインセミナー「デジタル進化生物セミナー」 2022)
アホロートルの巨大染色体の転写制御から再生四肢再生能力を紐解く
(第193回 n-bio バイオセミナー 2022)
Dynamics of the positional identity during limb regeneration
(広島大学両生類研究所内部セミナー 2022)
クロマチン構造から四肢の位置情報の再構築原理を紐解く
(国立遺伝学研究所バイオロジカルセミナー 2022)

学歴 (3件)：

2011 - 2014 奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科博士課程(荻野肇先生)
2009 - 2011 奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科修士課程 (荻野肇先生)
2009 - 長浜バイオ大学バイオサイエンス学科 (和田修一先生)

学位 (1件)：

バイオサイエンス博士 (奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科)

経歴 (4件)：

2022/07 - 現在国立遺伝学研究所分子生命史研究室 (主宰:工樂樹洋先生) 助教
2017/01 - 2022/06 オーストリア分子病理研究所 Animal regeneration (Dr. Elly Tanaka Lab) ポスドク研究員
2015/11 - 2016/12 ドレスデン再生医療研究センター (Dr. Elly Tanaka Lab) ポスドク研究員
2014/04 - 2015/10 長浜バイオ大学アニマルバイオサイエンス学科(荻野研究室) CREST研究員

受賞 (1件)：

2014/09 - 遺伝学会 86回年会ベストペーパー賞 The H3K27 demethylase, Jmjd3, regulates pax6 expression for eye development

所属学会 (5件)：

遺伝学会 , 動物学会 , International Society for Regenerative Biology (ISRB) , Society for Developmental Biology (SDB) , 発生生物学会

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