抄録/ポイント：
抄録/ポイント
文献の概要を数百字程度の日本語でまとめたものです。
部分表示の続きは、JDreamⅢ(有料)でご覧頂けます。
J-GLOBALでは書誌(タイトル、著者名等)登載から半年以上経過後に表示されますが、医療系文献の場合はMyJ-GLOBALでのログインが必要です。
約12,000種を有する1Fernは被子植物後の維管束植物の2番目に多様な系統である。それらは多数の分子系統発生研究の主題であり,全種のほぼ半分からすべての主要なクレードとDNA配列に対する樹木の公表をもたらした。地球規模のシダ類系統学は周期的に公表されているが,分子系統学研究は急速なペースで継続し,これらは急速に外れる。ここでは,GenBankで利用可能なDNA配列データから,連続更新したシダの生命(FTOL)を作出するために,ほとんど自動化された,再現可能なオープンパイプラインを開発した。著者らが調整したサンプリング戦略は,一般的に配列された色素体領域(多数の分類群,少数の遺伝子座)を有する全プラストーム(fwe分類群,多くの遺伝子座)を結合し,バックボーンに沿った高分解能とチップを横切る最大サンプリングを有する,地球規模の種レベルのシダ系統発生を得る。著者らは,コミュニティ駆動のPteridophytes PhylogenyグループI分類と一般コンプライアンスにおける同義語を解決するための参照分類法を使用した。現在のFTOLは,5582種を含み,最も最近発表されたグローバルなシダ系統発生と比較して約40%増加した。51のシダ化石制約の更新および拡張リストを用いて,著者らは,ほとんどの家族およびより深いクレードに対する推定年代を,以前の研究よりもかなり古いことを見出した。化石リストと分類データベースを含むFTOLとその随伴データセットは,規則的ベースで更新され,ウェブポータル(https://fernphy.github.io)とRパッケージにより利用可能であり,最も最新の,包括的にサンプリングされたシダ系統発生への即時アクセスを可能にする。FTOLは,小クレードから全樹木までの広範囲の分類学的尺度にわたって植物の重要なグループを研究するのに有用である。FTOLは,地域から地球規模でのマクロ生態学的研究に特に関連し,シダ系統発生の最も最近の仮説を持つ将来の分類体系を知らせるであろう。【JST・京大機械翻訳】
