MutSigCVsyn:30同義性癌ドライバーの同定【JST・京大機械翻訳】

Rao, Y.; Ahmed, N.; Pritchard, J.; O'Brien, E.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202201420483465 整理番号：22P0312516

MutSigCVsyn:30同義性癌ドライバーの同定【JST・京大機械翻訳】

MutSigCVsyn: Identification of Thirty Synonymous Cancer Drivers

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発行年： 2022年01月19日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月19日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

コードされた蛋白質配列ではなく,DNA配列のみを変化させる同義変異は,蛋白質構造と機能,mRNA成熟,およびmRNA半減期に影響を及ぼすことができる。同義変異が癌ドライバーとして作用する可能性はいくつかの最近の研究で探索されてきた。しかし,非同義癌ドライバーの正確な同定に影響することが知られている変異異質性の全3レベル(患者,組織学,および遺伝子)に対するこれらの研究制御のいずれもない。ここでは,これらレベルにわたる変異不均一性を考慮した,新しい非コード背景モデルに基づく同義癌ドライバーを同定するため,MutSigCVの適合であるMutSigCVsynのアルゴリズムを作成した。2,572のPCAWG癌全ゲノム配列,MutSigCVsynは,BCL-2のような有望な候補の突然変異を含む30の新規同義ドライバーを同定した。非同義運転者同定における最良の実践を同義運転者の解析にもたらすことにより,これらは将来の実験研究の有望な候補である。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

分子・遺伝情報処理 , 遺伝的変異 , 遺伝学研究法 , 腫ようの化学・生化学・病理学

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