プレプリント
J-GLOBAL ID:202202201625550769   整理番号:22P0320185

ゲノムワイド関連研究所見とヒト脳プロテオミクスデータの統合は物質使用形質における新規脳蛋白質を同定する【JST・京大機械翻訳】

Integrating Human Brain Proteomic Data with Genome-Wide Association Study Findings Identifies Novel Brain Proteins in Substance Use Traits
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発行年: 2022年02月04日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2022年02月04日
JST資料番号: O7002B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
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【背景】物質利用形質(SUTs)のために同定された遺伝的リスク遺伝子座の成長数の増加,蛋白質存在量に及ぼすこれらの遺伝子座の影響,および治療標的としてのそれらの可能性は不明である。【方法】これに取り組むために,著者らは,4つのSUTsのためのゲノムワイド関連研究(GWAS)要約統計によって,発見(Banner;N=152)と検証(ROSMAP;N=376)データセットからヒト脳プロテオームを統合することによって,プロテオームワイド関連研究(PWAS)を実行した。サンプルは,喫煙開始[Smk](N=1,232,091),アルコール使用障害[AUD](N=313,959),カンナビス使用障害[CUD](N=384,032),およびオピオイド使用障害[OUD](N=302,585)に対するヨーロッパ人種個人の4GWASから成った。”CUD](N=313,959),カンナビス使用障害[CUD](N=384,032),およびオピオイド使用障害[OUD](N=302,585)。プロテオームとトランスクリプトミクスレベルでの遺伝的影響の重複を調べるために,ヒト脳トランスクリプトームデータによるトランスクリプトームワイド関連研究(TWAS)を行い,Co局在分析を通しての因果律に対する有意な遺伝子を試験した。【結果】27の遺伝子(Smk=21,AUD=3,CUD=2,OUD=1)はシス調節脳蛋白質存在量と有意に関連していた。脳蛋白質量を調節することにより作用する6遺伝子(Smk:NT5C2,GMPPB,NQO1,SRR,ACTR1B;AUD:CTNND1)の因果関係の証拠があった。8つの遺伝子(Smk=6,CUD=1,OUD=1)に対するシス調節転写物レベルはSUTと関連し,遺伝子座が遺伝子発現とプロテオーム豊度の両方を調節することによりこれらのSUTのリスクを与えることを示唆した。結論:ここで同定された高信頼リスク蛋白質(SmkとCTNND1に対するSRR)の機能的研究は,それらが修飾可能な標的であり,これらのSUTのための薬物とバイオマーカーの開発に有用であるかどうかを決定するために必要である。【JST・京大機械翻訳】
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