差次的ヒストン-DNA相互作用はパイオニア転写因子Soxのヌクレオソーム認識を指示する【JST・京大機械翻訳】

Ozden, B.; Boopathi, R.; Barlas, A. B.; Lone, I. N.; Bednar, J.; Petosa, C.; Kale, S.; Hamiche, A.; Angelov, D.; Dimitrov, S.; Karaca, E.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202737120984 整理番号：22P0029228

差次的ヒストン-DNA相互作用はパイオニア転写因子Soxのヌクレオソーム認識を指示する【JST・京大機械翻訳】

Differential Histone-DNA Interactions Dictate Nucleosome Recognition of the Pioneer Transcription Factor Sox

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著者 (11件)： , , , , , , , , , ,
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発行年： 2022年11月17日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年11月17日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

Pioneer転写因子(PTF)は,重要な細胞過程を刺激するためにクロマチンに直接結合する顕著な能力を持っている。本研究では,広範な分子シミュレーションとDNAフットプリント法を結合することによりSox PTFの普遍的な結合モードを解析した。その結果,SoxコンセンサスDNAが溶媒面DNA鎖に位置するとき,Soxは有意な立体配座変化を課さずにコンパクトなヌクレオソームに結合することを示した。また,塩基特異的Sox:DNA相互作用(塩基読み)とSox誘導DNA変化(形状読み)が配列特異的DNA認識に同時に必要であることを明らかにした。異なるヌクレオソーム位置の中で,そのような特異的読取機構は,超螺旋位置2(SHL2)でのみ満足される。SHL2はSox結合に透明に作用するが,SHL4は形状読み取りのみを可能にし,SHL0(dyad)は読み取り機構を示さなかった。これらの知見から,Soxに基づくヌクレオソーム認識は,異なるヒストン-DNA相互作用によって本質的に誘導され,DNAの柔軟性の程度を変えることができることを初めて示した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現 , 遺伝子の構造と化学 , 生物学的機能

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