統合単一細胞プロファイリングはヒト腫瘍浸潤T細胞の細胞状態特異的エンハンサー景観を切断する【JST・京大機械翻訳】

Riegel, D.; Romero-Fernandez, E.; Simon, M.; Adenugba, A. R.; Singer, K.; Mayr, R.; Weber, F.; Imbusch, C. D.; Kreutz, M.; Brors, B.; Ugele, I.; Werner, J. M.; Siska, P. J.; Schmidl, C.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202205224678652 整理番号：22P0318343

統合単一細胞プロファイリングはヒト腫瘍浸潤T細胞の細胞状態特異的エンハンサー景観を切断する【JST・京大機械翻訳】

Integrated single-cell profiling dissects cell-state-specific enhancer landscapes of human tumor-infiltrating T cells.

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発行年： 2022年03月18日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月18日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

消耗T細胞のクロマチン景観に関する広範な研究にもかかわらず,ヒト腫瘍浸潤リンパ球(TILs)の不均一機能および機能不全状態の基礎となる転写配線は,不完全に理解されている。ここでは,単一細胞クロマチンプロファイリングを用いて4つの癌実体をカバーするCD8+TIL機能状態の広い幅における組織特異的および一般的な遺伝子調節景観を同定した。腫瘍実体マッチング試料から単一細胞RNA-seqデータと単一細胞クロマチン接近性を統合することにより,ヒトTILsにおけるエンハンサー-プロモーター相互作用をマップし,スーパーエンハンサー解析により主要要素を優先した。結果は,TIL機能不全に対するヒトコアクロマチン軌跡を明らかにし,この過程で重要なエンハンサー,転写調節因子および調節標的遺伝子を同定した。最後に,強力なCRISPR活性化剤とレプレッサーで非コード調節エレメントを標的化することにより,免疫治療関連遺伝子座でのエンハンサー調節を検証した。まとめると,本研究は,ヒト腫瘍浸潤リンパ球から細胞状態特異的遺伝子調節キューを理解し,操作するためのフレームワークを提供する。【JST・京大機械翻訳】

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, , 【Automatic Indexing@JST】

腫よう免疫 , 消化器の腫よう , 腫ようの免疫療法

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