プレプリント
J-GLOBAL ID:202202209528128930   整理番号:22P0326676

相対的生殖数を用いたSARS-CoV-2変異体の置換の時間経過の予測【JST・京大機械翻訳】

Predicting the time course of replacements of SARS-CoV-2 variants using relative reproduction numbers
著者 (2件):
資料名:
発行年: 2022年03月31日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2022年03月31日
JST資料番号: O7002B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
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重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)は,2019年にヒト集団への導入以来,連続的に進化した。自然選択は,より高い有効生殖数を有する変異体を選択し,循環ウイルスの全体的伝達性を増加させる。新しい変異体の効果的な制御対策を確立するためには,変異体置換の初期段階における伝達性と置換時間コースを知ることが重要である。本論文では,イングランドにおけるアルファからデルタへの変異体置換の遡及的予測試験を行った。著者らの方法は,最初に,相対生殖数,変異体の生殖数の比率を,ある時間点までの部分観測から,他のものと見積もった。第2に,時間点の後の置換時間コースは,相対再生数の推定に基づいて予測した。第3に,推定相対繁殖数と予測経時変化を,全観測を用いて推定したそれらと比較して評価した。Deltaの頻度が0.25以上の場合,アルファに関してデルタの相対再生数を推定することが可能であることを見出した。これらの相対的生殖数を用いて,Deltaの頻度が0.90に達したとき,Deltaの振動数が0.90に達したときの予測は,αに関して循環ウイルスの平均相対生殖数に対して,デルタの振動数に対して0.015の最大絶対予測誤差と0.067であった。これらの結果は,著者らの方法が変異体置換の初期相で観察される部分データセットから将来における変異体置換の経時変化を予測することができることを示唆する。【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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ウイルス感染の生理と病原性 

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