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J-GLOBAL ID：202202210354017417   整理番号：22A0649807

N182での部位特異的変異誘発によるZtaのbZIPドメインの二本鎖DNA特異性の変化【JST・京大機械翻訳】

Altering the Double-Stranded DNA Specificity of the bZIP Domain of Zta with Site-Directed Mutagenesis at N182

著者 (9件)： Ray Sreejana (Laboratory of Metabolism, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Maryland, United States) ,  Tillo Desiree (Laboratory of Metabolism, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Maryland, United States) ,  Tillo Desiree (Cancer Genetics Branch, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Maryland, United States) ,  Assad Nima (Laboratory of Metabolism, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Maryland, United States) ,  Ufot Aniekanabasi (Laboratory of Metabolism, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Maryland, United States) ,  Porollo Aleksey (Center for Autoimmune Genomics and Etiology, Division of Biomedical Informatics, Cincinnati Children’s Hospital Medical Center, Ohio, United States) ,  Porollo Aleksey (Department of Pediatrics, University of Cincinnati College of Medicine, Ohio, United States) ,  Durell Stewart R. (Laboratory of Cell Biology, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Maryland, United States) ,  Vinson Charles (Laboratory of Metabolism, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Maryland, United States)
資料名： ACS Omega  (ACS Omega)
巻： 7  号： 1  ページ： 129-139  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5044A  ISSN： 2470-1343  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Zta,Epstein-BarrウイルスbZIP転写因子(TF)は,配列特異的様式で非メチル化およびメチル化二本鎖DNA(dsDNA)の両方に結合する。4種類のdsDNAへの配列特異的dsDNA結合に対する保存アスパラギン(N182)の寄与を検討した。(i)両鎖((DNA-(C|C)),(ii,iii)dsDNA),(ii),5-メチルシトシン(5mC,M)または5-ヒドロキシメチルシトシン(5hmC,H)との二本鎖(DNA-(5mC|C)とDNA-(5hmC|C)),および(iv)すべてのCGジヌクレオチド((DNA-5mCG))における両鎖におけるメチル化シトシンを有するdsDNA。アスパラギンを5つの類似サイズのアミノ酸(グルタミン(Q),セリン(S),トレオニン(T),イソロイシン(I)またはバリン(V))で置換し,配列特異的dsDNA結合を評価するために蛋白質結合マイクロアレイを使用した。Ztaは優先的に偽-パリンドロームTRE(AP1)モチーフ(T-4G-3A-2G/C0T2C3A4)に結合する。Zta(N182Q)は1つの半部位でA3に結合する。Zta-(N182S)は,モチーフの1つまたは両方の半分でG3に結合する。Zta-(N182S)とZta-(N182Q)は,それぞれ34倍と17倍弱い中央値のdsDNA結合を有する。Zta-(N182V)とZta-(N182I)はdsDNA-(5mC|C)への結合を増加させた。分子動力学シミュレーションは,これら結果のいくつかを合理化し,グルタミンとA3の間の水素結合を同定したが,セリンがG3に優先的に結合する理由を明らかにしず,エントロピー相互作用がこの新しい結合特異性を仲介することを示唆した。Copyright 2022 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： エントロピー ,  水素結合 ,  相互作用 ,  メチル化 ,  *DNA【核酸】 ,  ジヌクレオチド ,  転写因子 ,  *部位特異的変異誘発 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族アルコール ,  脂肪族カルボン酸 ,  アミノアルコール ,  ヒドロキシ酸 ,  カルボアミド ,  ジカルボン酸 ,  第一アミン ,  窒素複素環化合物 ,  ウレア化合物
準シソーラス用語： *ドメイン構造 ,  分子動力学シミュレーション ,  *二本鎖DNA , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (4件)： セリン ,  グルタミン ,  アスパラギン ,  シトシン

タイトルに関連する用語 (5件)： 部位特異的変異誘発 ,  bZIP ,  ドメイン ,  二本鎖DNA ,  特異性