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J-GLOBAL ID：202202210639875924   整理番号：22A0499425

ライム細菌集団における最大抗原多様化と病原体多様性を克服するための進化戦略【JST・京大機械翻訳】

Maximum antigen diversification in a lyme bacterial population and evolutionary strategies to overcome pathogen diversity

著者 (13件)： Di Lia (Department of Biological Sciences, Hunter College, City University of New York, New York, NY, USA) ,  Akther Saymon (Graduate Center, City University of New York, New York, NY, USA) ,  Bezrucenkovas Edgaras (Department of Biological Sciences, Hunter College, City University of New York, New York, NY, USA) ,  Ivanova Larisa (Department of Microbiology, Immunology and Biochemistry, University of Tennessee Health Science Center, Memphis, TN, USA) ,  Ivanova Larisa (Pediatrics Department, New York Medical College, Valhalla, NY, USA) ,  Sulkow Brian (Department of Biological Sciences, Hunter College, City University of New York, New York, NY, USA) ,  Wu Bing (Department of Biological Sciences, Hunter College, City University of New York, New York, NY, USA) ,  Mneimneh Saad (Graduate Center, City University of New York, New York, NY, USA) ,  Mneimneh Saad (Department of Computer Science, Hunter College, City University of New York, New York, NY, USA) ,  Gomes-Solecki Maria (Department of Microbiology, Immunology and Biochemistry, University of Tennessee Health Science Center, Memphis, TN, USA) ,  Qiu Wei-Gang (Department of Biological Sciences, Hunter College, City University of New York, New York, NY, USA) ,  Qiu Wei-Gang (Graduate Center, City University of New York, New York, NY, USA) ,  Qiu Wei-Gang (Department of Physiology and Biophysics & Institute for Computational Biomedicine, Weil Cornell Medical College, New York, NY, USA)
資料名： ISME Journal  (ISME Journal)
巻： 16  号： 2  ページ： 447-464  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4507A  ISSN： 1751-7362  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 病原体とそれらの宿主の自然個体群は,病原体が宿主免疫を逃れるように多様化する腕レースに従事し,宿主は新しい免疫を進化させる。この共進化過程は,広く効果的なワクチンの開発および多様化病原体に対する診断に対する基本的な挑戦を提起する。マウスの自然対立遺伝子頻度と実験的免疫の調査に基づき,Lyme disease-causing細菌(Borrelia burgdorferi)の優勢な抗原である外表面蛋白質C(OspC)の自然変異体の高い抗原特異性を示した。予防対策の臨床開発に対するOspC抗原多様性の課題を克服するために,OspC抗原反応性を広げるために多くの進化情報戦略を実施した。特に,天然変異体生成合成OspC類似体とのアミノ酸差を最小化する配列を生成する,中心アルゴリズム-a遺伝的アルゴリズムは,米国北東部で共存した多様なライム病原体株に対する診断およびワクチン候補として最も有望である。機構的に,OspC分子上の超可変領域に分布するアミノ酸変異により媒介される最大抗原多様化(MAD)のモデルを提案した。MAD仮説の下で,進化的重心は,自然変異体を多様化することによって発掘された抗原空間における中心空洞を占有することによって,広い交差反応性を示す。連結エピトープに基づくワクチン設計とは対照的に,進化的アルゴリズムは天然抗原のアナログを生成し,自動化される。コンセンサスおよび祖先配列に基づく新規重心アルゴリズムおよび進化的抗原設計は,病原体-宿主共進化により駆動される多様化病原体と戦うための広い意味を持つ。Copyright The Author(s), under exclusive licence to International Society for Microbial Ecology 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  自動化 ,  *細菌 ,  *抗原 ,  *ライム ,  ワクチン ,  重心 ,  *病原体 ,  個体群 ,  多様化 ,  遺伝子頻度 ,  エピトープ ,  遺伝的アルゴリズム
準シソーラス用語： 交差反応性 ,  共進化 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 免疫反応一般  (ED03010T) ,  微生物感染の生理と病原性  (EG03053T)

タイトルに関連する用語 (7件)： ライム ,  細菌集団 ,  抗原 ,  多様化 ,  病原体 ,  多様性 ,  進化戦略