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J-GLOBAL ID：202202210729640944   整理番号：22A0639946

肺腺癌に対する有望な新規バイオマーカーと候補小分子薬剤:ハイスループットデータのバイオインフォマティクス解析からの証拠【JST・京大機械翻訳】

Promising novel biomarkers and candidate small-molecule drugs for lung adenocarcinoma: Evidence from bioinformatics analysis of high-throughput data

著者 (7件)： Li Chengrui ( Department of Anesthesiology, Lianshui People’s Hospital Affiliated to Kangda College of Nanjing Medical University, Huai’an, People’s Republic of China) ,  Wan Yufeng ( Department of Respiratory Medicine, The Affiliated Huai’an Hospital of Xuzhou Medical University and The Second People’s Hospital of Huai’an, Huai’an, Jiangsu 223002, People’s Republic of China) ,  Deng Weijun ( Department of Thoracic Surgery, Lianshui People’s Hospital Affiliated to Kangda College of Nanjing Medical University, Huai’an, People’s Republic of China) ,  Fei Fan ( Department of Anesthesiology, The First People’s Hospital of Taicang City, Taicang Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou, People’s Republic of China) ,  Wang Linlin ( Department of Respiratory Medicine, The First People’s Hospital of Taicang City, Taicang Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou, People’s Republic of China) ,  Qi Fuwei ( Department of Anesthesiology, The First People’s Hospital of Taicang City, Taicang Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou, People’s Republic of China) ,  Zheng Zhong ( Department of Anesthesiology, The First People’s Hospital of Taicang City, Taicang Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou, People’s Republic of China)
資料名： Open Medicine (Web)  (Open Medicine (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 96-112  発行年： 2022年 
JST資料番号： U8100A  ISSN： 2391-5463  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 肺腺癌(LUAD)は,不安定な予後と関連する非小細胞肺癌の最も一般的なサブタイプである。したがって,LUADのための標的薬剤と同様に,新規診断および予後バイオマーカーの同定のための緊急の需要がある。本研究は,LUADの病因と予後に関連する可能性のある新しいバイオマーカーを同定することを目的とした。遺伝子発現Omnibusデータベースからの3つのマイクロアレイデータセット(GSE10072,GSE31210,およびGSE40791)を,limmaパッケージを用いて正常およびLUADサンプルにおける差次的発現遺伝子(DEG)を同定するために統合した。バイオインフォマティクスツールを用いて,DEGに対する機能的およびシグナル伝達経路濃縮解析を行った。ハブ遺伝子の発現と予後値を,遺伝子発現プロファイリング相互作用分析とリアルタイム定量的ポリメラーゼ連鎖反応によってさらに評価した。さらに,DEGに基づいてLUADの腫瘍を逆転できる候補小分子を探索するために「連結性マップ」(CMap)をマイニングした。合計505のDEGを同定し,それは337の下方制御と168の上方制御された遺伝子を含んだ。PPIネットワークを,1,860相互作用と373ノードで確立した。遺伝子と関連した最も重要な経路と機能的濃縮は,それぞれ細胞接着と細胞外マトリックス-受容体相互作用であった。高い連結性度(ZWINT,RRM2,NDC80,KIF4A,CEP55,CENPU,およびCENPF)を有する7つのDEGを,より悪い生存と有意に関連していたが,ハブ遺伝子として選択した。最後に,LUAD遺伝子発現を逆転させる20の最も重要な小分子を同定した。この知見はLUADの開始と進行の分子機構を明らかにし,臨床診療における複数のバイオマーカーを統合するための新しい洞察を提供する。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  データベース ,  ネットワーク ,  遺伝子 ,  細胞接着 ,  予後 ,  *小分子 ,  遺伝子発現 ,  *肺腫瘍 ,  *腺癌 ,  ダウンレギュレーション ,  非小細胞肺癌 ,  PCR法 ,  *バイオマーカー ,  病因
準シソーラス用語： *肺腺癌 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 肺腺癌 ,  バイオインフォマティクス解析 ,  予後 ,  候補小分子 ,  新しいバイオマーカー

分類 (1件)： 呼吸器の腫よう  (GI04000G)

タイトルに関連する用語 (7件)： 肺腺癌 ,  バイオマーカー ,  小分子 ,  薬剤 ,  ハイスループット ,  バイオインフォマティクス解析 ,  証拠