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J-GLOBAL ID：202202210905186272   整理番号：22A0911039

交雑種ブタにおける体形質のためのハイスループットシークエンシングデータからの補完全ゲノム再シークエンシングに関する関連研究【JST・京大機械翻訳】

An association study on imputed whole-genome resequencing from high-throughput sequencing data for body traits in crossbred pigs

著者 (8件)： Li Cong (College of Animal Sciences and Technology, Henan Agricultural University, Zhengzhou, Henan, China) ,  Duan Dongdong (College of Animal Sciences and Technology, Henan Agricultural University, Zhengzhou, Henan, China) ,  Xue Yahui (College of Animal Sciences and Technology, Henan Agricultural University, Zhengzhou, Henan, China) ,  Han Xuelei (College of Animal Sciences and Technology, Henan Agricultural University, Zhengzhou, Henan, China) ,  Wang Kejun (College of Animal Sciences and Technology, Henan Agricultural University, Zhengzhou, Henan, China) ,  Qiao Ruimin (College of Animal Sciences and Technology, Henan Agricultural University, Zhengzhou, Henan, China) ,  Li Xiu-Ling (College of Animal Sciences and Technology, Henan Agricultural University, Zhengzhou, Henan, China) ,  Li Xin-Jian (College of Animal Sciences and Technology, Henan Agricultural University, Zhengzhou, Henan, China)
資料名： Animal Genetics  (Animal Genetics)
巻： 53  号： 2  ページ： 212-219  発行年： 2022年 
JST資料番号： T0281A  ISSN： 0268-9146  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 身体形質はブタ産業における重要な経済的因子である。ゲノムワイド関連研究(GWAS)は,ブタのQTLを検出するために高密度遺伝子型データを用いて広く適用されてきた。本研究の目的は,Illumina Porcine SNP50 BeadChipと完全全ゲノム配列データを用いて,交雑ブタにおける体形質と有意に関連した遺伝的変異を検出することであった。7つの身体特性,体長,体高,胸囲,非骨周囲,脚臀囲,背脂肪厚,および腰筋深さのセットを測定した。中程度から高い遺伝率は,ほとんどの形質(0.14から0.46まで)で得られ,それらの間の有意な遺伝的および表現型相関が観察された。GWASは,体形質に対するすべてのオートソーム上の39領域に位置する714の有意に関連するSNPと,PIK3CD,HOXA,PCGF2,CHST11,COL2A1,BMI1およびOSR2の合計7つの機能的に関連する候補遺伝子を同定した。機能的濃縮分析は,候補遺伝子がエストロゲンシグナリング経路,胚骨格系形態形成および胚骨格系発達に富んでいることを明らかにした。これらの結果は,ブタにおける体形質に焦点を当てた体発達とマーカー支援選択プログラムの根底にある遺伝的機構を明らかにすることを目的とする。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  ヌクレオチド配列 ,  *ブタ ,  *ゲノム ,  形態形成 ,  *交雑 ,  *雑種 ,  常染色体 ,  遺伝率 ,  *体格 ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： *配列解析 ,  胸囲 ,  ゲノム配列 ,  候補遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 身体形質 ,  候補遺伝子 ,  GWAS ,  補完 ,  ブタ

分類 (2件)： 豚  (FD02040U) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 交雑種 ,  ブタ ,  体形 ,  補完 ,  ゲノム ,  シークエンシング ,  研究