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J-GLOBAL ID：202202211177915666   整理番号：22A0731728

ペプチド天然物のin silico脱複製と遺伝子クラスタ分析を組み合わせた質量分析における分子ネットワーク化に基づく戦略【JST・京大機械翻訳】

Molecular networking-based strategies in mass spectrometry coupled with in silico dereplication of peptidic natural products and gene cluster analysis

著者 (3件)： McAvoy Andrew C. (School of Chemistry and Biochemistry, Georgia Institute of Technology, Atlanta, GA, United States) ,  Garg Neha (School of Chemistry and Biochemistry, Georgia Institute of Technology, Atlanta, GA, United States) ,  Garg Neha (Center for Microbial Dynamics and Infection, Georgia Institute of Technology, Atlanta, GA, United States)
資料名： Methods in Enzymology  (Methods in Enzymology)
巻： 663  ページ： 273-302  発行年： 2022年 
JST資料番号： T0576A  ISSN： 0076-6879  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ペプチド天然産物(PNP)は,それらが望ましい生物活性としばしば関連するので,薬剤開発にとって貴重な源である。構造活性相関の記述と組み合わせた化学酵素的アプローチは,最適化された生物活性を示すダプトマイシンおよびバンコマイシンのようなPNPへの類似体の生産を可能にした。生合成酵素の自然の混乱は,生産者生物が,1つの標的のための複数のヒットとして潜在的に役立ち,または,与えられた天然物の生物活性を多様化する種々の類似体を生成することを可能にする。したがって,天然抽出物中にそれらの存在をマイニングすることによる新規ペプチド天然物の迅速発見を可能にするアプローチを,天然産物生物化学者と化学者によって探索した。この章で,著者らは,in silicoツールと組み合わせた2つの異なる分子ネットワークに基づくアプローチが,粗抽出物で取得した非標的質量分析データからPNPを複製し,構造的に関連分子に注釈を伝播する方法を,どのように使用できるかを述べる。さらに,遺伝子クラスター分析と分子ネットワーク分析を結合することにより,酵素プロミクシティの知識を得るための段階を述べた。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 最適化 ,  *質量分析 ,  化学 ,  酵素 ,  生合成 ,  *ペプチド ,  構造活性相関 ,  *クラスタ ,  生産者 ,  生物活性 ,  合成酵素 ,  アミノ糖 ,  シクロペプチド ,  芳香族塩素化合物 ,  オリゴペプチド ,  多価フェノール ,  二糖類 ,  架橋化合物 ,  ピラノシド ,  芳香族縮合化合物 ,  ポリペプチド
準シソーラス用語： *in silico ,  *遺伝子クラスタ ,  *分子ネットワーク , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 分子ネットワーキング ,  メタボロミクス ,  ペプチド性天然物 ,  GNPS ,  質量分析 ,  生合成遺伝子クラスター ,  MIBiG

分類 (3件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  ペプチド  (CF10080G) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

物質索引 (2件)： バンコマイシン ,  ダプトマイシン

タイトルに関連する用語 (8件)： ペプチド ,  天然物 ,  複製 ,  遺伝子クラスタ ,  分析 ,  質量分析 ,  分子ネットワーク ,  戦略