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J-GLOBAL ID：202202211321926326   整理番号：22A0686387

de novoトランスクリプトーム解析による細菌黒病に対するフェアエビStreptocephalus sirindhornaeの免疫応答【JST・京大機械翻訳】

The immune response of fairy shrimp Streptocephalus sirindhornae against bacterial black disease by de novo transcriptome analysis

著者 (4件)： Thaimuangphol Wipavee (Laboratory of Fish Immunology and Nutrigenomics, Applied Animal and Aquatic Sciences Research Unit, Division of Fisheries, Faculty of Technology, Mahasarakham University, Khamriang Sub-District, Kantarawichai, Mahasarakham, 44150, Thailand) ,  Sanoamuang Laorsri (Applied Taxonomic Research Center, Faculty of Science, Khon Kaen University, Khon Kaen, 40002, Thailand) ,  Sanoamuang Laorsri (Laboratory of Biodiversity and Environmental Management, International College, Khon Kaen University, Khon Kaen, 40002, Thailand) ,  Wangkahart Eakapol (Laboratory of Fish Immunology and Nutrigenomics, Applied Animal and Aquatic Sciences Research Unit, Division of Fisheries, Faculty of Technology, Mahasarakham University, Khamriang Sub-District, Kantarawichai, Mahasarakham, 44150, Thailand)
資料名： Fish & Shellfish Immunology  (Fish & Shellfish Immunology)
巻： 121  ページ： 108-115  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1617A  ISSN： 1050-4648  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノム資源を増強し,病原体に対するフェアリーエビ(Streptocephalus sirindornae)の応答の根底にある分子免疫機構を理解するために,著者らは最初にAeromonas hydrophila免疫化エビおよびRNA配列決定による対照群からの比較遺伝子転写解析を行った。一方,差別的に発現された遺伝子(DEG)を調査して,合計46,958,894のクリーン読取を得て,次に,平均長さ993bpと1,458bpのN50を有する73,297のユニジーンに組み立てた。NR/NT/KO/SwissProt/PFAM/GOおよびKOGデータベースと比較して,単一遺伝子を注釈付けし,少なくとも1つのデータベースで28,198の単遺伝子(38.47%)を注釈した。細菌チャレンジ後,143および287の遺伝子が,それぞれ,著しくアップレギュレートまたはダウンレギュレートされ,345は,古典的免疫関連アポトーシス,toll様受容体およびMAPKシグナリング経路を含む142の経路と関連していた。さらに,10の異なる発現免疫関連遺伝子を,定量的リアルタイムPCRを用いて確認した。本研究は,正常およびAeromonas hydrophila免疫化S.sirindornaeの遺伝子発現パターンを初めて特性化し,その分子機構に新たな光を当て,この貴重な水産養殖種に対する病害防除プログラムの今後の努力を可能にした。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *細菌 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *免疫反応 ,  Aeromonas ,  病原体 ,  *遺伝学実験技術 ,  病害防除 ,  Aeromonas hydrophila ,  遺伝子発現 ,  アポトーシス ,  MAPキナーゼ
準シソーラス用語： 免疫法 ,  *トランスクリプトーム解析 ,  分子機構 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Aeromonas hydrophila ,  遺伝子発現 ,  PI3K/ATKシグナル伝達経路 ,  細菌感染症 ,  甲殻類免疫 ,  差次的発現遺伝子

分類 (1件)： 免疫反応一般  (ED03010T)

タイトルに関連する用語 (5件)： トランスクリプトーム解析 ,  細菌 ,  黒 ,  エビ ,  免疫応答