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J-GLOBAL ID:202202211505909032   整理番号:22A0842132

子宮頸癌における重要な経路の同定と7遺伝子予後シグネチャの確立【JST・京大機械翻訳】

Identification of Key Pathways and Establishment of a Seven-Gene Prognostic Signature in Cervical Cancer
著者 (3件):
資料名:
巻: 2022  ページ: Null  発行年: 2022年 
JST資料番号: U7781A  ISSN: 1687-8450  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: イギリス (GBR)  言語: 英語 (EN)
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子宮頸癌(CC)は,高い罹患率と死亡率のままである。頸部発癌の根底にある重要な経路を同定し,予後シグネチャを確立することを目的とした。遺伝子発現全バス(GEO)データベースからの6つのデータセットを用いて,CCと正常組織の間の差次的発現遺伝子(DEG)をスクリーニングした。機能的解析を行うために,DEGの結合を使用した。108の重複したDEGを分析し,コックス回帰と癌ゲノムアトラス(TCGA)データベースに基づくLasso分析による予後シグネチャを決定した。遺伝子セット濃縮分析(GSEA)と免疫細胞豊度同定装置(ImmuCellAI)を用いて,シグネチャと生物学的機能の間の関係を決定した。PI3K-Aktシグナリング経路,Rasシグナリング経路,およびウイルス発癌経路は,CC発達に重要である。リスクスコア式を構築するために7つの遺伝子(PLOD2,DSG2,SPP1,CXCL8,MCM5,HLTF,およびKLF4)を同定した。生存分析は,高リスク群が低リスク群[数式:原文を参照]より悪い予後を示したことを示した。予後徴候のAUCは,1,3および5年で0.7449,0.7641および0.8146であった。また,署名が独立予後因子であることを同定した。GSEAは,5つの経路が接着結合経路のようなシグネチャに関連することを示した。また,シグネチャは,B細胞,CD4+T細胞,およびCD8+T細胞などの種々のタイプの免疫細胞の豊度に影響した。さらに,SPP1はHK3,CD163,CCL3,CLEC5A,MMP8,TREM1,OLR1,およびTREM2と共発現することを見出した。遺伝子オントロジー分析の結果は,SPP1とその共発現関連蛋白質が主に代謝過程,多細胞生物過程,細胞コミュニケーション,細胞増殖,蛋白質結合,および輸送体活性に影響を及ぼすことを示した。結論として,本研究はCC発生の鍵となる経路を調査し,7遺伝子シグネチャはCC患者の予後評価を効果的に行うことができる。Copyright 2022 Ran An et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (2件):
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遺伝子発現  ,  腫ようの化学・生化学・病理学 
引用文献 (66件):
  • F. Bray, J. Ferlay, I. Soerjomataram, R. L. Siegel, L. A. Torre, A. Jemal, "Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries," CA: A Cancer Journal for Clinicians, vol. 68, no. 6, pp. 394-424, 2018.
  • S. Yu, C. S. Yang, J. Li, W. You, J. Chen, Y. Cao, Z. Dong, Y. Qiao, "Cancer prevention research in China," Cancer Prevention Research, vol. 8, no. 8, pp. 662-674, 2015.
  • X. Jiang, H. Tang, T. Chen, "Epidemiology of gynecologic cancers in China," Journal of gynecologic oncology, vol. 29, no. 1, 2018.
  • W. Chen, R. Zheng, S. Zhang, H. Zeng, T. Zuo, C. Xia, Z. Yang, J. He, "Cancer incidence and mortality in China in 2013: an analysis based on urbanization level," Chinese Journal of Cancer Research, vol. 29, no. 1, pp. 1-10, 2017.
  • H. Zur Hausen, "Papillomaviruses and cancer: from basic studies to clinical application," Nature Reviews Cancer, vol. 2, no. 5, pp. 342-350, 2002.
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