SAIBR:スペクトル自己蛍光補正のための単純でプラットフォームに依存しない方法【JST・京大機械翻訳】

Rodrigues, N. T. L.; Bland, T.; Borrego-Pinto, J.; Ng, K.; Hirani, N.; Gu, Y.; Foo, S.; Goehring, N. W.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202211901848764 整理番号：22P0312765

SAIBR:スペクトル自己蛍光補正のための単純でプラットフォームに依存しない方法【JST・京大機械翻訳】

SAIBR: A simple, platform-independent method for spectral autofluorescence correction

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発行年： 2022年01月20日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月20日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

生物学的システムは,遺伝子発現と局所蛋白質濃度の正確な定量を必要とする数学,物理学,およびシステムアプローチのレンズを通してますます見なされている。そのようなアプローチは,CRISPR/Cas9によってスパークされた遺伝子工学における革命から大いに恩恵を受ける。ゲノム遺伝子座での遺伝子の標識を促進することにより,CRISPR/Cas9は,自然調節制御下で内因性レベルで発現する蛋白質をモニターするための蛍光の利用を可能にする。しかし,それらの典型的に低い発現レベルのため,内因性標識遺伝子を用いた定量的実験は自己蛍光(AF)によって課される限界に実行できる。AFは,最も効率的な蛍光蛋白質(GFP,mNeonGreen)によって占有された照明バンドにおいて,しばしば特別な課題である。C.elegansにおける著者らの研究によって刺激して,著者らは,標準フィルタセットと照明条件を用いて自己蛍光を補正するために,単純,プラットフォーム独立プロトコル,および関連するGUIベースのFIJIプラグインの,スペクトル自己蛍光画像補正(SAIBR)を記述し,検証した。C.elegans胚での使用について完全に検証され,スターフィッシュ卵母細胞と分裂酵母を含む多様なシステムで試験され,SAIBRは蛍光団シグナルの正確な定量を達成し,弱い発現蛋白質の信頼性のある検出と定量を可能にする。したがって,SAIBRは,幅広い多様な細胞および発達系に作用する研究者のための標準としてAF補正を組み込むための高度にアクセス可能な,低いバリア方法を提供する。Summary Statementは使いやすいFiji Pluginとして,SAIBRは標準イメージング条件を用いて細胞および組織に対して効果的な自己蛍光補正を提供する。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝学研究法 , 遺伝子操作

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