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J-GLOBAL ID：202202212553547485   整理番号：22A1084999

作物改良におけるパンゲノミクス-パンゲノムグラフによる調節変異体発見のためのコーディング構造変異から【JST・京大機械翻訳】

Pangenomics in crop improvement-from coding structural variations to finding regulatory variants with pangenome graphs

著者 (10件)： Zanini Silvia F. (Dep. of Plant Breeding, IFZ Research Centre for Biosystems, Land Use and Nutrition, Justus Liebig Univ. Giessen, Giessen, 35392, Germany) ,  Bayer Philipp E. (School of Biological Sciences and Institute of Agriculture, Univ. of Western Australia, Perth, Western Australia, Australia) ,  Wells Rachel (Dep. of Crop Genetics, John Innes Centre, Norwich Research Park, Norwich, NR47UH, UK) ,  Snowdon Rod J. (Dep. of Plant Breeding, IFZ Research Centre for Biosystems, Land Use and Nutrition, Justus Liebig Univ. Giessen, Giessen, 35392, Germany) ,  Batley Jacqueline (School of Biological Sciences and Institute of Agriculture, Univ. of Western Australia, Perth, Western Australia, Australia) ,  Varshney Rajeev K. (Center of Excellence in Genomics & Systems Biology, International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Patancheru, India) ,  Varshney Rajeev K. (State Agricultural Biotechnology Centre, Centre for Crop Food Innovation, Food Futures Institute, Murdoch Univ., Murdoch, WA, Australia) ,  Nguyen Henry T. (Division of Plant Sciences, Univ. of Missouri, Columbia, MO, USA) ,  Edwards David (School of Biological Sciences and Institute of Agriculture, Univ. of Western Australia, Perth, Western Australia, Australia) ,  Golicz Agnieszka A. (Dep. of Plant Breeding, IFZ Research Centre for Biosystems, Land Use and Nutrition, Justus Liebig Univ. Giessen, Giessen, 35392, Germany)
資料名： Plant Genome  (Plant Genome)
巻： 15  号： 1  ページ： e20177  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5739A  ISSN： 1940-3372  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 2014年に初めて報告された作物パンゲノム以来,高スループットおよび費用対効果の高いDNA配列決定技術の進歩は,アブラナ(Brassica napus L.),ダイズ[Glycine max(L.)Merr.],イネ(Oryza sativa L.),コムギ(Triticum aestivum L.)およびオオムギ(Hordeum vulgare L.)のパンゲノムを含む複数のそのような研究を容易にした。単一参照ゲノムと比較して,パンゲノムは種に存在する遺伝的変異のより正確な表現を提供する。多重アクセッションのゲノムデータを結合することにより,パンゲノムは,種内の遺伝的多様性の主要な決定因子の1つである構造変化(SV)のような複雑なDNA多型の検出と注釈を可能にする。このレビューにおいて,作物パンゲノミクスに関する現在の文献をまとめ,農業的関心の形質に関与する候補SVsを見つけるためのそれらの適用に焦点を当てた。次に,非コード調節配列とそれらの変異の発見と機能的特性化におけるパンゲノムの可能性を強調する。著者らは,コーディングおよび非コード要素の注釈を含む植物パンゲノムの完全な内容を示す革新的データ構造に関する要約および展望と,トランスクリプトミクスおよびエピゲノム実験の成果を結論づけた。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *農作物 ,  オオムギ ,  コムギ ,  調節遺伝子 ,  ヌクレオチド配列 ,  *ゲノム ,  多重化 ,  アブラナ ,  遺伝現象
準シソーラス用語： 費用対効果 ,  トランスクリプトーム解析 ,  DNA配列 ,  ハイスループット ,  遺伝的変異 ,  DNA多型 ,  構造変化 ,  エピゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 麦  (FC03033M) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 作物 ,  パンゲノミクス ,  調節 ,  変異体 ,  発見 ,  コーディング ,  変異