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J-GLOBAL ID：202202212991200707   整理番号：22A0832133

「時間の回答」:胆管培養のためのナノポアシークエンシングを用いた前向き臨床試験【JST・京大機械翻訳】

“Answers in hours”: A prospective clinical study using nanopore sequencing for bile duct cultures

著者 (16件)： Yonkus Jennifer A. (Division of Hepatobiliary & Pancreatic Surgery, Department of Surgery, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Whittle Emma (Division of Surgical Research, Department of Surgery; Microbiome Program, Center for Individualized Medicine, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Alva-Ruiz Roberto (Division of Hepatobiliary & Pancreatic Surgery, Department of Surgery, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Abdelrahman Amro M. (Division of Hepatobiliary & Pancreatic Surgery, Department of Surgery, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Horsman Susan E. (Department of Pharmacy, College of Medicine, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Suh Gina A. (Division of Infectious Disease, Department of Medicine, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Cunningham Scott A. (Division of Clinical Microbiology, Department of Laboratory Medicine and Pathology, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Nelson Heidi (Division of Research and Optimal Patient Care, Cancer Programs, American College of Surgeons, Rochester, MN) ,  Grotz Travis E. (Division of Hepatobiliary & Pancreatic Surgery, Department of Surgery, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Smoot Rory L. (Division of Hepatobiliary & Pancreatic Surgery, Department of Surgery, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Cleary Sean P. (Division of Hepatobiliary & Pancreatic Surgery, Department of Surgery, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Nagorney David M. (Division of Hepatobiliary & Pancreatic Surgery, Department of Surgery, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Kendrick Michael L. (Division of Hepatobiliary & Pancreatic Surgery, Department of Surgery, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Patel Robin (Division of Infectious Disease, Department of Medicine, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Truty Mark J. (Division of Hepatobiliary & Pancreatic Surgery, Department of Surgery, Mayo Clinic, Rochester, MN) ,  Chia Nicholas (Division of Surgical Research, Department of Surgery; Microbiome Program, Center for Individualized Medicine, Mayo Clinic, Rochester, MN)
資料名： Surgery  (Surgery)
巻： 171  号： 3  ページ： 693-702  発行年： 2022年 
JST資料番号： C0796B  ISSN： 0039-6060  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 外科的部位感染は,膵頭切除を受ける患者における罹患率の主要源であり,しばしば術中胆管培養における生物からである。このように,多くの施設は,胆管培養に基づき,長期予防抗生物質およびテーラーを使用している。しかし,標準培養は,長期抗生物質に不必要な多くの患者を残す。ナノポア配列決定は,時間内にデータを提供し,したがって,抗生物質のステーシップを改善する可能性がある。本研究では,術中胆汁試料中のナノポア配列決定の実現可能性を検討した。膵頭部切除術を受けた患者を含めた。術中胆汁微生物プロファイルを標準培養とナノポア配列決定で測定した。抗生物質の推奨を作成し,両方法について時間から結果を決定した。臓器収量,耐性パターン,抗生物質推奨,およびコストを比較した。42名の患者のうち,22名(52%)が陽性標準培養をもたらす試料を有した。すべての陽性標準培養は,ナノポア配列を用いて検出した微生物を持っていた。陰性標準培養の20人の患者すべては,陰性ナノポア塩基配列決定を持った。ナノポア配列決定は,標準培養(10.5対4.4,p<0.05)およびより耐性遺伝子型(10.3対2.7,p<0.05)と比較して,より多くの細菌種を検出した。ナノ細孔配列決定に基づく抗菌推奨は,44(61%)試料から27の標準培養のための被覆を提供し,これらの試料の27(48%)のうち13のナノポア配列決定によって推奨されたより広い被覆率を有した。ナノポア配列決定の結果は標準培養よりも速い(8対98時間)が,より高い関連コスト(165対38.49)を有した。ナノ細孔配列決定による迅速な微生物プロファイリングは,標準培養と比較して,より広い生物と耐性プロファイリングで実現可能である。ナノポア配列決定は,完全な陰性予測値を有し,潜在的に抗生剤を改良できる。したがって,ランダム化比較試験は開発中である。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 微生物 ,  細菌 ,  抗生物質 ,  胆汁 ,  ヌクレオチド配列 ,  可能性 ,  臨床試験 ,  予防 ,  *胆管 ,  被覆率 ,  ランダム化比較試験
準シソーラス用語： *ナノ細孔 ,  耐性遺伝子 ,  予測値 ,  プロファイリング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 消化器疾患の外科療法  (GH05030R)

タイトルに関連する用語 (5件)： 回答 ,  胆管 ,  培養 ,  ナノポアシークエンシング ,  臨床試験