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J-GLOBAL ID：202202213147813937   整理番号：22A0828146

亜急性脊髄損傷後の長鎖非コードRNAの同定と共調節パターン解析【JST・京大機械翻訳】

Identification and coregulation pattern analysis of long noncoding RNAs following subacute spinal cord injury

著者 (9件)： Wang Wenzhao (Department of Orthopedics, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, Sichuan, China) ,  Ma Liang (Department of Orthopedic, Affiliated Hospital of Shandong University of Traditional Chinese Medicine, Jinan, Shandong, China) ,  Li Jun (Department of Orthopedics, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, Sichuan, China) ,  Yang Shang-You (Department of Orthopaedic Surgery, University of Kansas School of Medicine-Wichita, Wichita, Kansas, USA) ,  Yi Zheng (Department of Cariology and Endodontics, State Key Laboratory of Oral Diseases, National Clinical Research Center for Oral Diseases, West China Hospital of Stomatology, Sichuan University, Chengdu, Sichuan, China) ,  Sun Mingjie (Department of Orthopedic, Jinan Central Hospital affiliated to Shandong University, Jinan, Shandong, China) ,  Chen Jianan (Department of Orthopedic, Jinan Central Hospital affiliated to Shandong University, Jinan, Shandong, China) ,  Xie Wei (Department of Orthopedics, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, Sichuan, China) ,  Xie Wei (Department Emergency Medicine, The Second Affiliated Hospital of Shandong First Medical University, Taian, Shandong, China)
資料名： Journal of Orthopaedic Research  (Journal of Orthopaedic Research)
巻： 40  号： 3  ページ： 661-673  発行年： 2022年 
JST資料番号： W2653A  ISSN： 0736-0266  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 長い非コードRNA(lncRNA)は,真核細胞における転写後および転写調節において決定的な調節的役割を果たすことが示されている。しかしながら,多くのlncRNAの特性,特に亜急性脊髄損傷(SCI)後の脊髄組織の病変震央における発現パターンは,不明のままである。本研究では,外傷性SCI後の脊髄組織の病変震央におけるlncRNAの発現プロファイルを決定し,潜在的調節ネットワークを予測した。標準アレン滴手術をマウスで行い,ヘマトキシリンとエオシン染色を用いて損傷領域を観察した。ハイスループット配列決定を行い,lncRNAの差次的発現プロファイルを同定した。定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応を行い,配列決定結果の品質を評価した。遺伝子オントロジーおよびゲノム経路解析,共発現解析,および蛋白質-蛋白質相互作用分析を含むバイオインフォマティクス分析を実施した。lncRNA-miRNA-mRNAの標的化結合は,標的ScanとmiRandaにより予測された。合計230の差次的発現lncRNAを同定し,予備的に検証し,いくつかの潜在的調節ネットワークを構築した。これらの知見は亜急性SCIの基礎となる機構の理解を改善する。差次的に発現したlncRNAは複数の経路を調節することにより病態生理学的過程に密接に関与する。さらなる研究は,in vivoおよびin vitroでの競合する内因性RNA経路の基礎となる正確な機構を明らかにするために必須である。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  生物学 ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  *脊髄 ,  転写【遺伝】 ,  マウス ,  ゲノム ,  遺伝的調節 ,  遺伝子発現 ,  ターゲティング ,  in vitro実験
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  *非翻訳RNA ,  バイオインフォマティクス ,  共発現 ,  転写調節 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 生物情報学 ,  長鎖非コードRNA ,  規制ネットワーク ,  亜急性脊髄損傷

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 急性脊髄損傷 ,  長鎖非コードRNA ,  同定 ,  調節 ,  パターン解析