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J-GLOBAL ID:202202213325225155   整理番号:22A1178602

ヒト食道癌の潜在的予後バイオマーカーおよび治療標的としてのクロモボックスファミリーメンバーの同定と検証【JST・京大機械翻訳】

Identification and Validation of Chromobox Family Members as Potential Prognostic Biomarkers and Therapeutic Targets for Human Esophageal Cancer
著者 (18件):
資料名:
巻: 13  ページ: 851390  発行年: 2022年 
JST資料番号: U7071A  ISSN: 1664-8021  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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背景:クロモボックスファミリー蛋白質(CBXs)はエピジェネティック調節複合体の必須成分であり,クロマチンを修飾することにより標的遺伝子を転写的に阻害する。蓄積された証拠は,CBXが多発性悪性腫瘍の開始と進行に関与することを示す。しかし,食道癌(ESCA)における異なるCBXの予後および診断値のような発現,機能および臨床的関連性はまだ不明である。【方法】ESCAにおけるCBXファミリーメンバーの役割を調査するために,Oncomin,TCGA,GEO,GEPIA,UALCAN,Kaplan-Meierプロット,cBioPortal,Metascope,およびTIMERを適用した。さらに,定量的リアルタイムPCR(RT-PCR),ウェスタンブロットおよび免疫蛍光法を用いて,ESCA臨床試料におけるCBXファミリーメンバーの発現を検証した。結果:正常組織と比較して,CBX1/3/8のmRNA発現レベルはESCAで有意に増加したが,CBX7 mRNA発現はTCGAコホートとGEOコホートの両方で減少した。TCGAコホートにおいて,ROC曲線は,CBX1/2/3/4/8がESCAにおいて大きな診断価値を持ち,AUCが0.9以上であったことを示唆した。さらに,CBX1/3/8のアップレギュレーションとCBX7のダウンレギュレーションは,腫瘍グレード,腫瘍結節転移状態,およびTP53突然変異状態のようなESCA患者における臨床病理学的パラメータに密接に関連していた。生存分析は,より高いCBX1/3/8 mRNA発現およびより低いCBX7発現がESCAにおいて好ましくない予後を示唆した。CBXの高い遺伝的変化率(52%)がESCA患者で見いだされた。CBXsにおける突然変異の機能と経路,およびESCA患者におけるそれらの50の頻繁に変化した近隣遺伝子を調査した。結果は,DNA修復とDNA複製がCBX変化と相関することを示した。さらに,CBXファミリーメンバーの発現レベルとESCAにおける免疫細胞の浸潤との間に有意な相関を見出した。最後に,臨床試料におけるCBXファミリーメンバーの発現を検証し,結果がデータベースと一致することを見出した。結論:この研究は,CBX1/3/7/8がESCA患者に対する精度治療の可能性のある標的であり,予後に対する新しいバイオマーカーであることを示す。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
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遺伝子発現  ,  細胞構成体一般  ,  腫ようの化学・生化学・病理学 
引用文献 (57件):
  • AdemaV., CollaS. (2022). EZH2 Inhibitors: The Unpacking Revolution. Cancer Res. 82 (3), 359-361. doi: 10.1158/0008-5472.Can-21-4311
  • BrayF., FerlayJ., SoerjomataramI., SiegelR. L., TorreL. A., JemalA. (2018). Global Cancer Statistics 2018: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. CA: A Cancer J. Clinicians 68 (6), 394-424. doi: 10.3322/caac.21492
  • CaoW., LeeH., WuW., ZamanA., McCorkleS., YanM., et al (2020). Multi-Faceted Epigenetic Dysregulation of Gene Expression Promotes Esophageal Squamous Cell Carcinoma. Nat. Commun. 11 (1), 3675. doi: 10.1038/s41467-020-17227-z
  • CeramiE., GaoJ., DogrusozU., GrossB. E., SumerS. O., AksoyB. A., et al (2012). The cBio Cancer Genomics Portal: An Open Platform for Exploring Multidimensional Cancer Genomics Data. Cancer Discov. 2 (5), 401-404. doi: 10.1158/2159-8290.CD-12-0095
  • ChanH. L., MoreyL. (2019). Emerging Roles for Polycomb-Group Proteins in Stem Cells and Cancer. Trends Biochem. Sci. 44 (8), 688-700. doi: 10.1016/j.tibs.2019.04.005
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