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J-GLOBAL ID：202202213400924695   整理番号：22A1143873

植物育種におけるメタボロミクスの最近の応用

Recent applications of metabolomics in plant breeding

著者 (1件)： Sakurai Nozomu (Bioinformation and DDBJ Center, National Institute of Genetics)
資料名： Breeding Science  (Breeding Science)
巻： 72  号： 1  ページ： 56-65(J-STAGE)  発行年： 2022年 
JST資料番号： Y0311B  ISSN： 1344-7610  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： 日本 (JPN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 代謝産物は,生物生命の維持,および栄養価,芳香,色,ストレス耐性のような作物表現型の定義化において中心的役割を果たす。生物学の「omes」の中で,メタボロームは表現型に最も近い。従って,メタボロミクスは,化学組成の変化のモニタリング,細胞機能の基礎をなす機構の解明,マーカーと診断法の発見,mQTL,mGWAS,代謝産物-ゲノム予測に関する表現型決定に応用されてきた。本レビューでは,植物育種関連研究へのメタボロミクスの最新の応用に関する359のレポートを調査した。主要作物に加えて,希少薬用植物を含む160以上の他の作物を検討した。メタボロミクスの使用に関連する1つのボトルネックは,代謝産物の同定と定量に関連するデータおよびその曖昧さを得るために用いられる多様な機器である。植物育種へのメタボロミクスの応用を促進するために,技術の特徴と展望を考察する。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *作物育種 ,  *解析 ,  代謝産物 ,  質量分析 ,  NMR【磁気共鳴】 ,  量的形質遺伝子座 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  表現型 ,  細胞生理 ,  情報
準シソーラス用語： QTL【遺伝】 ,  *メタボロミクス ,  最新情報 ,  細胞機能

著者キーワード (5件)： メタボロミクス ,  質量分析 ,  核磁気共鳴 ,  mQTLL ,  mGWAS

分類 (2件)： 作物育種一般  (FC02010K) ,  物質の代謝  (EH02050Q)

引用文献 (90件)：

• Abreu, I.N., R.M. Brennan, E.N. Kanichukattu, D. Stewart, R.D. Hancock, G.J. McDougall and C.A. Hackett (2020) Quantitative trait loci mapping of polyphenol metabolites in blackcurrant (Ribes nigrum L.). Metabolomics 16: 25.
• Afendi, F.M., T. Okada, M. Yamazaki, A. Hirai-Morita, Y. Nakamura, K. Nakamura, S. Ikeda, H. Takahashi, M. Altaf-Ul-Amin, L.K. Darusman et al. (2012) KNApSAcK family databases: Integrated metabolite-plant species databases for multifaceted plant research. Plant Cell Physiol 53: e1.
• Alseekh, S. and A.R. Fernie (2021) Using metabolomics to assist plant breeding. Methods Mol Biol 2264: 33-46.
• Alseekh, S., F. Scossa, W. Wen, J. Luo, J. Yan, R. Beleggia, H.J. Klee, S. Huang, R. Papa and A.R. Fernie (2021) Domestication of crop metabolomes: Desired and unintended consequences. Trends Plant Sci 26: 650-661.
• Alves Filho, E., L.M. Silva, Y. Lima, P. Ribeiro, E. Silva, G. Zocolo, K. Canuto, S. Morais, A.C. Castro and E. de Brito (2019) Metabolomic variability of different genotypes of cashew by LC-Ms and correlation with near-infrared spectroscopy as a tool for fast phenotyping. Metabolites 9: 121.

タイトルに関連する用語 (3件)： 植物育種 ,  メタボロミクス ,  応用