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J-GLOBAL ID：202202213700752937   整理番号：22A0790449

RT-PCR/MALDI-TOFマルチターゲットアプローチによるSARS-CoV-2変異体のロバスト臨床検出【JST・京大機械翻訳】

Robust clinical detection of SARS-CoV-2 variants by RT-PCR/MALDI-TOF multitarget approach

著者 (34件)： Hernandez Matthew M. (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Banu Radhika (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Gonzalez-Reiche Ana S. (Department of Genetics and Genomic Sciences, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  van de Guchte Adriana (Department of Genetics and Genomic Sciences, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Khan Zenab (Department of Genetics and Genomic Sciences, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Shrestha Paras (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Cao Liyong (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Chen Feng (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Shi Huanzhi (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Hanna Ayman (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Alshammary Hala (Department of Microbiology, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Fabre Shelcie (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Amoako Angela (Department of Microbiology, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Obla Ajay (Department of Genetics and Genomic Sciences, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Alburquerque Bremy (Department of Genetics and Genomic Sciences, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Alburquerque Bremy (The Graduate School of Biomedical Sciences, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Patino Luz Helena (Centro de Investigaciones en Microbiologia y Biotecnologia-UR (CIMBIUR), Facultad de Ciencias Naturales, Universidad del Rosario, Bogota, Colombia) ,  Ramirez Juan David (Centro de Investigaciones en Microbiologia y Biotecnologia-UR (CIMBIUR), Facultad de Ciencias Naturales, Universidad del Rosario, Bogota, Colombia) ,  Sebra Robert (Department of Genetics and Genomic Sciences, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Sebra Robert (Icahn Institute for Data Science and Genomic Technology, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Sebra Robert (Black Family Stem Cell Institute, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Sebra Robert (Sema4, a Mount Sinai Venture, Stamford, Connecticut, USA) ,  Gitman Melissa R. (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Nowak Michael D. (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Cordon-Cardo Carlos (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Schutzbank Ted E. (Senior Scientific Affairs Manager, Infectious Diseases, Agena Bioscience, San Diego, California, USA) ,  Simon Viviana (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Simon Viviana (Department of Microbiology, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Simon Viviana (Division of Infectious Diseases, Department of Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Simon Viviana (The Global Health and Emerging Pathogens Institute, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  van Bakel Harm (Department of Genetics and Genomic Sciences, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  van Bakel Harm (Icahn Institute for Data Science and Genomic Technology, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Sordillo Emilia Mia (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA) ,  Paniz-Mondolfi Alberto E. (Department of Pathology, Molecular, and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, USA)
資料名： Journal of Medical Virology  (Journal of Medical Virology)
巻： 94  号： 4  ページ： 1606-1616  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0726B  ISSN： 0146-6615  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： コロナウイルス病2019(COVID-19)パンデミックは,重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)診断の急速な発展を火花した。しかし,新たな変異体は,プライマー/プローブ結合部位(PBS)ミスマッチに二次的な標的ドロップアウトと偽陰性結果のリスクをもたらす。Agena MassARRAY SARS-CoV-2パネルは,逆転写ポリメラーゼ鎖反応とマトリックス支援レーザ脱離/イオン化飛行時間型質量分析を組み合わせて,NとORF1ab遺伝子にわたる5つの標的を探し,それは,多様なウイルスにおけるPBSミスマッチを収容するロバストなプラットフォームを提供する。ここでは,2020年12月から2021年4月までのMount Sinai健康システム(ニューヨーク市)からの1262のSARS-CoV-2-陽性試料の脱同定データセットを利用して,目標結果および対応する配列データを評価した。全体として,PBSミスマッチのレベルは,標的ドロップアウトを有する標本においてより大きかった。N3ターゲットドロップアウトを有する試料の中で,57%はA28095T置換を,α(B.1.1.7)変異体に対して高度に特異的であった。これらのデータは,標的設計における冗長性の利点と,循環SARS-CoV-2変異体の動力学を明らかにするターゲット性能の可能性を強調する。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： イオン化 ,  質量分析 ,  脱着 ,  プローブ ,  冗長性 ,  遺伝子 ,  *突然変異体 ,  結合部位 ,  *コロナウイルス科 ,  *ロバスト性 ,  逆転写 ,  PCR法
準シソーラス用語： コロナウイルス ,  *重症急性呼吸器症候群 ,  偽陰性 ,  飛行時間 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： B.1.1.7 ,  診断 ,  ドロップアウト ,  MALDI-TOF ,  RT-PCR ,  SARS-CoV-2 ,  変異体

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： RT-PCR ,  MALDI-TOF ,  マルチターゲット ,  SARS-CoV-2 ,  変異体 ,  ロバスト ,  臨床