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J-GLOBAL ID：202202213741495317   整理番号：22A1173011

SARS-CoV-2陽性被験者の死後肺サンプルにおけるスパイクとORF1ab RNAの可変レベル:ISHとRT-PCRの比較【JST・京大機械翻訳】

Variable levels of spike and ORF1ab RNA in post-mortem lung samples of SARS-CoV-2-positive subjects: comparison between ISH and RT-PCR

著者 (22件)： Zito Marino Federica (Pathology Unit, Department of Mental and Physical Health and Preventive Medicine, Universita degli Studi della Campania “L Vanvitelli”, Naples, Italy) ,  De Cristofaro Tiziana (IEOS - Institute of Experimental Endocrinology and Oncology ‘G. Salvatore’, National Research Council, Naples, Italy) ,  De Cristofaro Tiziana (BioMol Laboratories srl, Naples, Italy) ,  Varriale Massimo (BioMol Laboratories srl, Naples, Italy) ,  Zannini Giuseppa (Pathology Unit, Department of Mental and Physical Health and Preventive Medicine, Universita degli Studi della Campania “L Vanvitelli”, Naples, Italy) ,  Ronchi Andrea (Pathology Unit, Department of Mental and Physical Health and Preventive Medicine, Universita degli Studi della Campania “L Vanvitelli”, Naples, Italy) ,  La Mantia Elvira (Pathology Unit, Department of Mental and Physical Health and Preventive Medicine, Universita degli Studi della Campania “L Vanvitelli”, Naples, Italy) ,  Campobasso Carlo Pietro (Department of Experimental Medicine, University of Campania, Naples, Italy) ,  De Micco Francesco (Department of Experimental Medicine, University of Campania, Naples, Italy) ,  Mascolo Pasquale (Department of Experimental Medicine, University of Campania, Naples, Italy) ,  Municino Maurizio (Forensic Medicine Unit, “S. Giuliano” Hospital, Giugliano in Campania, Italy) ,  Municino Emilia (Forensic Medicine Unit, “S. Giuliano” Hospital, Giugliano in Campania, Italy) ,  Vestini Francesco (Forensic Medicine Unit, “S. Giuliano” Hospital, Giugliano in Campania, Italy) ,  Pinto Omero (Forensic Medicine Unit, “S. Giuliano” Hospital, Giugliano in Campania, Italy) ,  Moccia Marta (Forensic Medicine Unit, “S. Giuliano” Hospital, Giugliano in Campania, Italy) ,  De Stefano Noe (Pathology Unit, “San Giuseppe Moscati” Hospital, Avellino, Italy) ,  Nappi Oscar (Istituto Diagnostico “Varelli”, Naples, Italy) ,  Sementa Carmen (Forensic Medicine Unit, AORN “San Giuseppe Moscati, Avellino, Italy) ,  Zotti Giovanni (Forensic Medicine Unit, ASL Salerno, Salerno, Italy) ,  Pianese Lamberto (Forensic Medicine Unit, ASL Avellino, Avellino, Italy) ,  Giordano Carmela (Forensic Medicine Unit, UOPC ASL NA3sud, Naples, Italy) ,  Franco Renato (Pathology Unit, Department of Mental and Physical Health and Preventive Medicine, Universita degli Studi della Campania “L Vanvitelli”, Naples, Italy)
資料名： Virchows Archiv  (Virchows Archiv)
巻： 480  号： 3  ページ： 597-607  発行年： 2022年 
JST資料番号： W0856A  ISSN： 0945-6317  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 死後検査は,SARS-CoV-2の病理生物学を理解する際に重要な役割を果たす。したがって,死後ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織のウイルス検出の最適化が必要である。逆転写ポリメラーゼ鎖反応(RT-PCR),免疫組織化学(IHC),in situハイブリダイゼーション(ISH),および電子顕微鏡を含むSARS-CoV-2の同定に,異なる技術が利用可能である。本研究の主目的は,陽性死亡被験者の死後肺サンプルにおけるSARS-CoV-2を検出するために,ISH対RT-PCRを比較することである。エンベロープ(E),ヌクレオカプシド(N),スパイク(S)およびオープンリーディングフレーム(ORF1ab)遺伝子およびISH標的SおよびOrf1abを含むSARS-CoV-2の異なるウイルスRNA配列を標的とするRT-PCRにより,合計27のサンプルを分析した。すべての27症例は,N遺伝子増幅,27のうちの22のE遺伝子増幅,26のS遺伝子増幅,および6つのORF1ab遺伝子増幅を示した。S ISHはRT-PCRにより陽性の26例中12例で陽性であった。強い染色と拡散染色を伴うS ISH陽性症例は,S RT-PCRによる増幅サイクル数の低い値との相関を示し,ISHが高レベルのS RNAを運ぶ場合,主に高感度アッセイであることを示唆した。結論として,著者らの知見は,ISHアッセイがRT-PCRと比較してFFPEにおいてSARS-CoV-2を検出する感度が低いことを示した。しかし,それは形態を保存するので,ウイルスを細胞状況に局在化できる。Copyright The Author(s) 2022 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 最適化 ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *死 ,  染色 ,  エンベロープ ,  遺伝子増幅 ,  逆転写 ,  PCR法 ,  *RT-PCR法 ,  免疫組織化学
準シソーラス用語： ヌクレオカプシド ,  *重症急性呼吸器症候群 ,  ウイルスRNA ,  オープンリーディングフレーム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： SARS-CoV-2 ,  逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR) ,  in situハイブリダイゼーション(ISH) ,  死後肺サンプル ,  スパイク(S) ,  オープンリーディングフレーム(ORF1ab)

分類 (1件)： 腫ようの診断  (GE03020J)

タイトルに関連する用語 (7件)： SARS-CoV-2 ,  被験者 ,  肺 ,  サンプル ,  RNA ,  可変 ,  RT-PCR