文献

J-GLOBAL ID：202202214558673739   整理番号：22A0912810

8-Furylimidazolo-2′-デオキシシチジン:結晶構造,充填,アトロプ異性および蛍光【JST・京大機械翻訳】

8-Furylimidazolo-2′-deoxycytidine: crystal structure, packing, atropisomerism and fluorescence

著者 (6件)： Budow-Busse Simone (Center for Nanotechnology, Muenster, Germany) ,  Jana Sunit K. (Center for Nanotechnology, Muenster, Germany) ,  Kondhare Dasharath (Center for Nanotechnology, Muenster, Germany) ,  Daniliuc Constantin (Westfaelische Wilhelms-Universitaet Muenster, Muenster, Germany) ,  Seela Frank (Center for Nanotechnology, Muenster, Germany) ,  Seela Frank (Universitaet Osnabrueck, Osnabrueck, Germany)
資料名： Acta Crystallographica. Section C. Crystal Structure Communications  (Acta Crystallographica. Section C. Crystal Structure Communications)
巻： 78  号： 3  ページ： 141-147  発行年： 2022年 
JST資料番号： D0185B  ISSN： 0108-2701  CODEN： ACSCEE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 8-Furylimidazolo-2′-デオキシシチジン(furImidC),C_14H_14N_4O_5は2′-デオキシシチジンの蛍光類似体であり,同じ認識面も示した。DNAの成分として,furImidCは異常に強い銀媒介自己対を形成する。結晶構造決定は,furImidCが2種類の無秩序残基,すなわち糖単位とフリル部分を採用することを明らかにした。糖残留物の無秩序は87:13分裂であった。フリル環の無秩序は,核酸塩基を複素環に接続するC8-C2′′結合での軸キラリティーから生じる。2つのアトロプ異性体は,不均等な割合[0.69(2)と0.31(2)]の[占有率]に存在し,核酸塩基とフリル部分は共平面である。支配的な占有を持つ原子部位を考慮すると,χ=-147.2(7)°のanti立体配座がグリコシル結合で見出され,2′-デオキシリボシル部分はP=160.0°のC2′-endo(S,2T_1)立体配座を示した。フラノースパッカリングの1H NMRに基づく立体配座分析は,S立体配座が溶液中でも支配的であることを明らかにした。固体状態では,2つの隣接furImidC分子は頭-尾様式で配置されるが,互いに関して分子の顕著な傾斜を有する。その結果,一つのN-H...N水素結合が1層内の隣接分子に対して見出され,一方,第二のN-H...N水素結合が隣接層の分子に形成される。さらに,核酸塩基と糖残基の間に水素結合が観察された。Hirshfeld表面分析を行い,X線研究で観測される分子間相互作用を可視化した。さらに,種々の極性と粘度の溶媒中でfurImidCの蛍光スペクトルを測定した。furImidCはミクロ環境変化(極性と粘度)に応答するが,これは高粘度の溶媒中のフリル残基の妨害回転によって説明される。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： NMR【磁気共鳴】 ,  *蛍光 ,  蛍光スペクトル ,  *結晶構造 ,  水素結合 ,  粘度 ,  分子間相互作用 ,  立体配座 ,  DNA【核酸】 ,  可視化 ,  複素環化合物 ,  *アトロプ異性 ,  デオキシリボヌクレオシド ,  ピリミジンヌクレオシド
準シソーラス用語： キラリティ ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 8-furylimidazolo-2′-デオキシシチジン ,  結晶構造 ,  アトロプ異性 ,  結晶充填 ,  Hirshfeld表面解析 ,  蛍光

分類 (2件)： ヌクレオシド,ヌクレオチド  (CF10060K) ,  核酸一般  (EB04010U)

物質索引 (1件)： デオキシシチジン

タイトルに関連する用語 (4件)： 2′-デオキシシチジン ,  結晶構造 ,  アトロプ異性 ,  蛍光