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J-GLOBAL ID：202202214660228044   整理番号：22A0437541

M ycoplasma hyopneumoniae仮説蛋白質の再アノテーションは新規の潜在的毒性因子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Reannotation of M ycoplasma hyopneumoniae hypothetical proteins revealed novel potential virulence factors

著者 (12件)： Tavares Bryan Augusto da Rosa (Laboratorio de Genomica Estrutural e Funcional, Centro de Biotecnologia, Universidade Federal do Rio Grande Do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Brazil) ,  Tavares Bryan Augusto da Rosa (Programa de Pos-Graduacao em Biologia Celular e Molecular, Centro de Biotecnologia, UFRGS, Porto Alegre, Brazil) ,  Paes Jessica Andrade (Laboratorio de Genomica Estrutural e Funcional, Centro de Biotecnologia, Universidade Federal do Rio Grande Do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Brazil) ,  Paes Jessica Andrade (Programa de Pos-Graduacao em Biologia Celular e Molecular, Centro de Biotecnologia, UFRGS, Porto Alegre, Brazil) ,  Zaha Arnaldo (Laboratorio de Genomica Estrutural e Funcional, Centro de Biotecnologia, Universidade Federal do Rio Grande Do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Brazil) ,  Zaha Arnaldo (Programa de Pos-Graduacao em Biologia Celular e Molecular, Centro de Biotecnologia, UFRGS, Porto Alegre, Brazil) ,  Zaha Arnaldo (Laboratorio de Biologia Molecular de Cestodeos, Centro de Biotecnologia, UFRGS, Porto Alegre, Brazil) ,  Zaha Arnaldo (Departamento de Biologia Molecular e Biotecnologia, Instituto de Biociencias, UFRGS, Porto Alegre, Brazil) ,  Ferreira Henrique Bunselmeyer (Laboratorio de Genomica Estrutural e Funcional, Centro de Biotecnologia, Universidade Federal do Rio Grande Do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Brazil) ,  Ferreira Henrique Bunselmeyer (Programa de Pos-Graduacao em Biologia Celular e Molecular, Centro de Biotecnologia, UFRGS, Porto Alegre, Brazil) ,  Ferreira Henrique Bunselmeyer (Laboratorio de Biologia Molecular de Cestodeos, Centro de Biotecnologia, UFRGS, Porto Alegre, Brazil) ,  Ferreira Henrique Bunselmeyer (Departamento de Biologia Molecular e Biotecnologia, Instituto de Biociencias, UFRGS, Porto Alegre, Brazil)
資料名： Microbial Pathogenesis  (Microbial Pathogenesis)
巻： 162  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： T0489A  ISSN： 0882-4010  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Mycoplasma hyopneumoniaeはブタ気道に生息する細菌であり,ブタ伝染性肺炎を引き起こし,世界的にブタ産業に重大な経済的損失を発生させる。M.hyopneumoniae生物学と病原性に関する知識は,ゲノム研究により有意に増加した。しかし,予測蛋白質の約30%はこれまで未知の機能のままである。元のアノテーションによると,ブラジルの病原性株であるM.hyopneumoniae7448のゲノムは,693のコードDNA配列を持ち,そのうち244は仮想または未特性化蛋白質のコードとして注釈付けされた。それらの中で,未知の毒性因子をコードするいくつかの遺伝子が存在する可能性がある。したがって,本研究は,新規潜在的毒性因子を予測するために,現在利用可能なデータベースおよび生物情報学ツールに基づいて,未知の機能の244M.hyopneumoniae7448蛋白質の全セットを機能的に再注釈することを目的とした。物理化学的性質,細胞内局在性,機能,病原性と抗原性への全体的関連の予測を提供した。未知機能の244蛋白質のセットのうち159は,それらに関連する推定機能を有し,新規酵素,膜輸送体,リポ蛋白質,DNA結合蛋白質及びアドヘシンの同定を可能にした。さらに,139の蛋白質は,一般に病原性と関連し,その内の14は機能を持ち,M.hyopneumoniaeの病原性と非病原性株の間で差次的に発現した。さらに,全ての細胞外または細胞質膜予測蛋白質は推定エピトープを同定した。全体として,これらの分析はM.hyopneumoniae7448ゲノムの機能的アノテーションを65%から87%に改善し,新しい潜在的毒性因子の同定を可能にした。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  酵素 ,  遺伝子 ,  細胞膜 ,  *タンパク質 ,  肺炎 ,  ゲノム ,  病原性 ,  免疫原性 ,  Mycoplasma ,  DNA結合タンパク質 ,  エピトープ ,  *アノテーション
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  DNA配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Mycoplasma hyopneumoniae ,  ブタの流行性肺炎 ,  ゲノムアノテーション ,  未知機能の蛋白質 ,  病原性因子

分類 (2件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  細菌による動物の伝染病  (FE02023A)

タイトルに関連する用語 (4件)： 仮説 ,  蛋白質 ,  アノテーション ,  毒性因子