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J-GLOBAL ID：202202215256745991   整理番号：22A0735085

直接検出,血清型分類および次世代シークエンシングによる細菌性髄膜炎の実験室診断: ニューヨーク州における10年間の試験は検査診断および公衆衛生を改善するために進化した【JST・京大機械翻訳】

Laboratory diagnosis of bacterial meningitis by direct detection, serotyping and Next Generation Sequencing: How 10 years of testing in New York State has evolved to improve laboratory diagnosis and public health

著者 (16件)： Long James R. (Wadsworth Center, New York State Department of Health, United States) ,  Mitchell Kara (Wadsworth Center, New York State Department of Health, United States) ,  Edwards Justine (Wadsworth Center, New York State Department of Health, United States) ,  Wroblewski Danielle (Wadsworth Center, New York State Department of Health, United States) ,  Luke Elizabeth (Wadsworth Center, New York State Department of Health, United States) ,  Dickinson Michelle (Wadsworth Center, New York State Department of Health, United States) ,  Kidney Anna (Wadsworth Center, New York State Department of Health, United States) ,  Dumas Nellie (Wadsworth Center, New York State Department of Health, United States) ,  DelRosso Paula (Bureau of Communicable Disease, New York City Department of Health & Mental Hygiene, United States) ,  Dorsinville Marie (Bureau of Communicable Disease, New York City Department of Health & Mental Hygiene, United States) ,  Antwi Mike (Bureau of Communicable Disease, New York City Department of Health & Mental Hygiene, United States) ,  Weiss Don (Bureau of Communicable Disease, New York City Department of Health & Mental Hygiene, United States) ,  Nazarian Elizabeth (Wadsworth Center, New York State Department of Health, United States) ,  Limberger Ronald J. (Wadsworth Center, New York State Department of Health, United States) ,  Musser Kimberlee A. (Wadsworth Center, New York State Department of Health, United States) ,  Halse Tanya A. (Wadsworth Center, New York State Department of Health, United States)
資料名： Molecular and Cellular Probes  (Molecular and Cellular Probes)
巻： 61  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： T0429A  ISSN： 0890-8508  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 2005年以降,Wadsworthセンター(WC)は,ニューヨーク州とニューヨーク市における疫学者との密接な共同で脳脊髄液(CSF)と全血標本に関する分子試験を提供している。本研究では,細菌性髄膜炎の病原体に対する患者標本を評価するために,分子法を利用する重要な値を実証するために10年間のデータを分析した。細菌性髄膜炎(Neisseria meningitidis,Streptococcus pneumoniae,Haemophilus influenzaeおよびStreptococcus agalactiae)を引き起こすことが知られている,血清型/血清型細菌薬剤を検出する包括的分子試験アルゴリズムは進化し,遡及的標本試験は各改善に必須であった。2010年から2019年までの10年間にわたって,WCは細菌性髄膜炎を疑われた634人の患者から831の検体を受けた。リアルタイムPCRは,183人の患者(29%)からの223(27%)標本の少なくとも1つの薬剤に対して陽性であった。223の陽性のうち,146(66%)を血清型/血清型にリアルタイムPCRによってさらに特性化した。さらに,同じ患者からのCSFと全血の131対の標本の検査は,CSFでより良い検出を見つけたが,全血はCSFが利用できないとき,診断のための有用な代替法である。最初にPCR陰性16S rDNA Sanger配列決定を146ケースのサブミッターにより要求し,追加24(16%)試料で細菌薬剤を同定した。遡及的研究において,次世代シークエンシング(NGS)を,53の以前に試験したPCR陰性CSF標本における病原体の検出に対して評価し,14(26%)標本において細菌を同定した。この分子試験アルゴリズムは,培養が治療をガイドする可能性で陰性である場合,臨床医が診断を提供する。また,抗生物質予防が必要で,コミュニティ罹患率のより完全な画像を得るために監視データを増強し,細菌性髄膜炎を引き起こす薬剤のスペクトルにおけるギャップを強調するために,公衆衛生を援助した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  *細菌 ,  抗生物質 ,  *細菌感染症 ,  連鎖球菌属 ,  *公衆衛生 ,  病原体 ,  *遺伝学実験技術 ,  *髄膜炎 ,  疫学 ,  *血清型 ,  臨床検査 ,  *中枢神経系感染症 ,  リアルタイムPCR法
準シソーラス用語： *細菌性髄膜炎 ,  後向き研究 ,  臨床医 ,  全血 ,  *次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 細菌性髄膜炎 ,  リアルタイムPCR ,  16S ,  次世代シークエンシング ,  脳脊髄液 ,  臨床検査診断

分類 (4件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  微生物検査法  (EG02020G) ,  疫学  (GB03000E) ,  呼吸器の診断  (GI02000S)

タイトルに関連する用語 (9件)： 血清型分類 ,  次世代シークエンシング ,  細菌性髄膜炎 ,  実験室診断 ,  ニューヨーク ,  試験 ,  検査診断 ,  公衆衛生 ,  進化