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J-GLOBAL ID：202202215366340988   整理番号：22A0804627

Capsicum annuum L.-Phytophthora capsici L.病原系の統合RNA-Seq解析は分子クロストークと宿主防御応答の活性化を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Integrative RNA-Seq analysis of Capsicum annuum L.-Phytophthora capsici L. pathosystem reveals molecular cross-talk and activation of host defence response

著者 (5件)： Rabuma Tilahun (Department of Bio and Nano Technology, Guru Jambheshwar University of Science and Technology, Hisar, Haryana, India) ,  Rabuma Tilahun (Department of Biotechnology, College of Natural and Computational Science, Wolkite University, Wolkite, Ethiopia) ,  Gupta Om Prakash (Division of Quality and Basic Sciences, ICAR-Indian Institute of Wheat and Barley Research, Karnal, Haryana, India) ,  Yadav Manju (Department of Bio and Nano Technology, Guru Jambheshwar University of Science and Technology, Hisar, Haryana, India) ,  Chhokar Vinod (Department of Bio and Nano Technology, Guru Jambheshwar University of Science and Technology, Hisar, Haryana, India)
資料名： Physiology and Molecular Biology of Plants  (Physiology and Molecular Biology of Plants)
巻： 28  号： 1  ページ： 171-188  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4848A  ISSN： 0971-5894  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： トウガラシ(Capsicum annuum L.)は経済的に最も重要な香辛料の1つである。しかし,その生産性は,病原体,Phytophthora capsici Lによって高度に影響を受ける。C.annuum-P.capsici病原系における防御応答に関連する分子機構の現在の理解は限られている。本研究はRNA-seq技術を用いて,P.capsici感染に曝露した2つの対照的な在来種,すなわちGojamMecha9086(レシタント)とDabat_80045(Susceptable)におけるP.capsici感染に対する防御応答に関連する遺伝子を解離した。トウガラシの4つの葉試料(RC,RI,SCとSI)からのトランスクリプトームは,52,384のプールされたユニジーンと共に合計118,879の組み立てられた転写産物をもたらした。転写物の濃縮分析は,5つの主なカテゴリー下で23の異なるKEGG経路を示した。2つの在来種(研究下)の774および484の差次的発現遺伝子(DEG)から,それぞれ,RC対RIおよびSC対SI葉サンプルにおいて,P.capsici感染に対する防御応答と関連するように,それぞれ57および29DEGを観察した。6つのランダムに選択した遺伝子のqRT-PCR分析は,Illumina NextSeq500配列決定の結果を検証した。全部で58の転写因子ファミリー(bHLH最も豊富な)と2095の蛋白質ファミリー(Proteinキナーゼが最も豊富な)が,RIとSI試料で最大のヒットを有するすべてのサンプルにわたって観察された。発現解析により,分子機能,細胞成分及び生物学的プロセシングの共有協調による防御及びシグナル伝達応答に関連する遺伝子の特異的調節を明らかにした。ここで示した結果は,P.capsici感染に対するトウガラシにおける防御応答に関する我々の理解を強化し,分子育種家が耐性チリ遺伝子型の開発に利用できることを示した。Copyright Prof. H.S. Srivastava Foundation for Science and Society 2022 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *応答 ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  *トウガラシ ,  病原体 ,  遺伝学実験技術 ,  *Phytophthora ,  在来種 ,  細胞情報伝達 ,  転写因子 ,  *トウガラシ属 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *防御応答 ,  差次的遺伝子発現 ,  RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Capsicum annuum ,  Phytophthora capsici ,  トランスクリプトーム配列 ,  差次的遺伝子発現

分類 (3件)： 野菜  (FC03043X) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (10件)： Capsicum ,  Phytophthora ,  統合 ,  RNA-seq ,  解析 ,  分子 ,  クロストーク ,  宿主 ,  防御応答 ,  活性化