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J-GLOBAL ID：202202215578096084   整理番号：22A0679583

対立遺伝子不均一性の存在における遺伝子発現の遺伝的調節の組織特異性の再定義【JST・京大機械翻訳】

Redefining tissue specificity of genetic regulation of gene expression in the presence of allelic heterogeneity

著者 (7件)： Arvanitis Marios (Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins University, Baltimore, MD 21211, USA) ,  Arvanitis Marios (Department of Medicine, Division of Cardiology, Johns Hopkins University, Baltimore, MD 21205, USA) ,  Tayeb Karl (Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins University, Baltimore, MD 21211, USA) ,  Strober Benjamin J. (Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins University, Baltimore, MD 21211, USA) ,  Battle Alexis (Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins University, Baltimore, MD 21211, USA) ,  Battle Alexis (Department of Computer Science, Johns Hopkins University, Baltimore, MD 21211, USA) ,  Battle Alexis (Department of Genetic Medicine, Johns Hopkins University, Baltimore, MD 21205, USA)
資料名： American Journal of Human Genetics  (American Journal of Human Genetics)
巻： 109  号： 2  ページ： 223-239  発行年： 2022年 
JST資料番号： B0360B  ISSN： 0002-9297  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子発現に対する遺伝的変異の機能的影響を明らかにすることは,組織生物学および複雑な形質の病因を理解する上で重要である。多くのヒト組織にわたる発現量的形質遺伝子座(eQTLs)を地図化する大きな努力にもかかわらず,ヒト疾患を理解するこれらの知見を翻訳する能力は不完全であり,大部分の疾患遺伝子座は標的遺伝子の発現との関連で説明されていない。多くのeQTLに対する細胞型特異性と複数の独立した原因変異の存在は,疾患遺伝子座との見かけの不一致に寄与する潜在的交絡因子である。本研究では,遺伝子発現に対する遺伝的影響の組織特異性および疾患遺伝子座との重複を調べ,一方,組織内および組織内の複数の原因変異体の存在を考察した。eQTLsの広範な組織特異性の証拠を見出し,しばしば,伝統的なメタアナリシスアプローチを誤リードする連鎖不均衡によりマスクされる。著者らは,CAFEH(対立遺伝子異質性の存在における共局在と微細マッピング)を提案し,複数の形質にわたる遺伝的関連データを統合するBayes法,連鎖不均衡を組み込み,原因変異体を同定した。CAFEHは,共局在と微細マッピングにおいて以前のアプローチより優れている。CAFEHを用いて,高度に組織特異的な遺伝的影響を有する遺伝子は,分化および発生過程に富んで,ヒト疾患に関与する可能性が高い,より大きな選択下にあることを示す。最後に,CAFEHはゲノムワイド関連複合体形質遺伝子座における標的組織を優先する遺伝子発現の遺伝子調節における広範な対立遺伝子不均一性を効率的に利用し,それによって複雑な形質遺伝学を解釈する能力を改善することを示した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生物学 ,  *遺伝子 ,  ヒト ,  *組織特異性 ,  複合体 ,  遺伝的影響 ,  *遺伝的調節 ,  *対立遺伝子 ,  *遺伝子発現 ,  病因 ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： 連鎖不平衡 ,  疾患遺伝子 ,  標的遺伝子 ,  遺伝的変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： eQTLL ,  GWAS ,  共局在化 ,  ファインマッピング ,  組織特異性

分類 (1件)： 遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (5件)： 対立遺伝子 ,  不均一性 ,  遺伝子発現 ,  遺伝的調節 ,  組織特異性